| 各位大侠： 本人之前的课题是希望能找出人的某种体液中的特异蛋白质（即A样本中存在，而B样本中不存在），所以将2样本送至公司做了全蛋白质谱分析（仪器是triple TOF 5600），结果回来后发现A样本中有500多个蛋白在B样本中都不存在。现在的问题是如果我需要进行后续的大样本量的定量检测，该如何选择检测蛋白呢？我不可能把500多个蛋白全部都做一遍，有没有什么选择的秘诀之类的。目前拿到的数据除了原始的raw，mgf文件，就是公司给出的分析数据，包括Protein Mass，Coverage，Isoelectric Point， # of unique peptide， # of unique spectrum，# of spectrum。实在是不知道该怎么进行下一步了，请各位帮忙！ |
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