离子阱的气相色谱质谱仪目前的厂家只有瓦里安和热电，型号分别为saturn 2000系列、saturn4000和Polaris Q,Saturn 2000系列是内离子源质谱，该型号致命缺点就是分析时所有由毛细管流出的组分均进入阱内并被离子化，基体干扰和溶剂化效应严重，经常导致M+1的峰，EI全扫质谱图与标准普库匹配性差，导致在无标样的情况下定性困难，另外如果样品浓度差别太大，得到的谱图也不完全一致，定量线性范围窄，离子阱容易脏，需要经常清洗；saturn4000是瓦里安推出没几年的内外源离子阱质谱，相对先前的2000系列来说，质量范围变宽了，可以做多溴联苯醚（2000的质量只能到650m/z），性能比2000系列要好一些；Polaris Q是外源的，结构简单，性能要优于瓦里安的2000系列，质谱图匹配性也好于2000，但是气相部分个更换衬管和进样垫麻烦一些。
根据本人的使用经验，Polaris Q总体上要优于2000系列，saturn 4000接触不多，不敢妄加评论。至于有人说（可能是销售人员）仅仅是因为离子阱可以做多级质谱功能，价格就比单级四极杆高昂，其实未必，从结构来讲，四极杆远比离子阱复杂，这就决定了离子阱的价格不可能远高于单级四极杆，否则就是上当受骗了。
从单级质谱来讲，四极杆的定性和定量明显要比离子阱好；从多级质谱来比较，QQQ也要优于离子阱的二级质谱，但是价格远高于离子阱质谱。

看来也是位使用的朋友，我的观点和你一致，
大家想一想，超音速协和飞机的命运？
建议，如果不是纯粹研究单位或是玩质谱有几年的朋友，不要玩离子阱，那个油门不是你随便以为就能控制的，加上多级质谱产生大量的数据不仅需要电脑大量处理，还需要长期积累的经验判断，
如果你是按某种要求完成你试验任务的，还是四极杆稳当，如果有M，QQQ当然最好。

而且大家忽略了测试样品的问题，到底我们是经常面对奇怪物质还是常规物质呢？如果整天面对复杂、奇怪样品，那除了学校或高等研究所，还有哪些？

在此对自认玩离子阱的高手表示崇高敬意！

学习，激动，我一直用离子阱，总感觉灵敏度比四极杆差一点，真差一点

仪器比较老了

瓦里安 GC3800-Saturn 2000MS/MS

使用它也快四年了，感觉内源的，做PCI 和EI可以随时切换，方便省事，可做多级质谱，如果是做质谱裂解研究的话，不错

我主要做农药残留分析

确实存在不如四极杆的定量范围等问题，但在农残方面，本来测定的化合物的浓度就不高，所以定量线性范围我们做出来也还是非常好的，高浓度时会有饱和状态出现，呵呵

我习惯用多级质谱，呵呵，另外仪器可更改调试优化的参数比较多，这点比较喜欢

二级的裂解能量自动方法开发功能不错，呵呵，省去很多时间来逐个能量优化，呵呵

不知道你对质谱的认识如何？一般初级用户可以考虑购买单四级杆气质联用仪，有标准谱库，操作简单方便；对于有一定的有机质谱进样的用户，可以考虑购买离子阱质谱；归于复杂分析体系，当然购买串联四级杆质谱比较好啊。

在使用瓦里安的4000离子阱，主要在分析挥发性有机物，全扫的功能用得最多，主要用了吹扫和冷阱浓缩系统，灵敏度足够了。质核比有时候会发现有点漂移。瓦里安的串联四级杆不错，我们用的320，用的MRM模式一直在分析农药残留

质谱菜鸟，学习了

很深入的讨论，收获不少

再谈谈自己的一些体会，请大家多多指教。
大学毕业后有幸参与了质谱仪器的研发工作，对离子阱质谱有些不成熟的看法：
1 离子阱的原理首先是将带电子捕获、储存在阱内，然后再通过射频和AC信号共同作用，再把离子激发出阱外。其中储存和激发的控制是比较困难的，也还是影响影响性能指标的重要因素。相比之下，四极杆（包括三重四极）都是通过射频的变化对离子进行筛选。原理上就简单了很多很多，而且容易控制和实现。
2 所以对是离子捕获、储存和激发的精确控制一直是制约离子阱性能提升的一个瓶颈。其难点在于：如何抑制离子的空间电荷效应？进入阱内的离子不能太多也不能太少。如何将运动的离子完美束缚在一个给定的空间（3D是一个点，线性是一条线）？ 在激发前让同一质荷比的离子具有相同的初始能量。如何精确地将离子激发出来？
3 以上的问题不是单单提高射频信号、直流信号和交流信号的性能指标就能解决的。从离子阱的发展来看，3D阱到线性阱，甚至是矩形阱都是从阱的结构上做文章，力求达到更加完美的场型，从而达到优化性能指标的目的。但是这种改进并没有简化离子捕获、储存和激发的过程，只是通过场型的变化使控制变得精准些。
4 至于阱内电离、阱外电离、光电离等等都没有改变离子阱实质的工作过程，对性能提高也是有限的。

总结一下：由于原理的特殊性，使得离子阱的实现比较复杂，也导致离子阱的调试和使用需要相当的经验。个人觉得从使用的角度，离子阱不如四极杆（包括三重四极）好用。

谈的太有道理了，现在我这有一台VARIAAN离子阱，一台AGILENT单四极杆。离子阱相比之下要娇气的多！！！