色谱柱的分离度与长度成正比，与柱内径的平方根成反比。也就是说同样固定液的色谱柱，在内径相同的情况下，长度越长，分离度越高；长度相同的情况下，内径越小，分离度越高。
大口径的毛细管柱的柱容量比较大，可以不用分流直接进样，做微量组份（如农残）的检测时比较常用，方便将检出限的下限降低；
小口径的毛细管柱的柱容量小，要求分流进样，这样最终到检测器的样品量就降低了很多（只有通过进样口进样的量的几十分之一）。