很有可能是仪器系统尤其是色谱柱吸附作用的残留。

碰到生物样品质谱响应升高或降低一点也不用奇怪。原因五花八门，我提供一点点建议参考。
　如果对照品响应值不稳定可以先调节一下质谱参数，这方面比较容易做到，注意质谱上平衡时间较长的是离子源温度；如果对照品响应值稳定可以排除质谱检测器的问题，要在离子化效率上找原因，看看哪些因素可能导致离子化效率提高。如果发现基质效应明显，可以调节保留时间，以分析时间换取分析质量；或者在洗脱分析物后加一个高浓度洗脱的过程使色谱柱更干净。
　注意到你采用了缓冲盐，响应值逐渐升高可能是生物样品破坏了原有的平衡，对策有两个方向，其一增加缓冲盐浓度，或换用其他；其二改变样品前处理方法，使样品更加“干净",或减少进样体积。
　　从你的叙述分析你所用的内标是不合适的，基本肯定用的不是氘代同位素内标，建议换内标。