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  • It is me!

    第31楼2009/06/30

    值得一提的是,各种模板的引物设计难度不一。有的模板本身条件比较困难,例如GC含量偏高或偏低,导致找不到各种指标都十分合适的引物;用作克隆目的的PCR,因为产物序列相对固定,引物设计的选择自由度较低。在这种情况只能退而求其次,尽量去满足条件。
    做Real Time时,用于SYBR Green I法时的一对引物与一般PCR的引物,在引物设计上所要求的参数是不同的。引物设计的要求:
    1)避免重复碱基,尤其是G.
    2)Tm=58-60度。
    3)GC=30-80%.
    4)3'端最后5个碱基内不能有多于2个的G或C.
    5)正向引物与探针离得越近越好,但不能重叠。
    6)PCR扩增产物长度: 引物的产物大小不要太大,一般在80-250bp之间都可;80~150 bp最为合适(可以延长至300 bp)。
    7)引物的退火温度要高,一般要在60度以上;

    要特别注意避免引物二聚体和非特异性扩增的存在。

    而且引物设计时应该考虑到引物要有不受基因组DNA污染影响的能力,即引物应该跨外显子,最好是引物能跨外显子的接头区,这样可以更有效的不受基因组DNA污染的影响。

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  • It is me!

    第32楼2009/06/30

    影响PCR的因素太多了,往往有些是怎么想都想不同的问题。

    如果实验室条件不是特别特别好的话,夏天和冬天做PCR时,如果比较倒霉的话就会有很大的差别。而且都是分子级别的东西,看不见,摸不着,会很郁闷的。。。。有时候就是很很很很很很郁闷。。

    我曾经就有半年的时间利用PCR做定点突变,,,怎么做就是PCR扩增不出来,,,实在是郁闷到底。。。。最后把老板也搞郁闷了。。



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  • It is me!

    第35楼2009/08/14

    PCR结束后就是电泳分析了。

    电泳技术目前发展得还算是比较成熟的。对于大片断,一般500bp以上采用琼脂糖凝胶电泳。对于小片断,想获得高分辨率的电泳图一般用PAGE 电泳。

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  • yanzishcn

    第36楼2009/09/16

    楼主写得很好,多谢!加油接着写啊!

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  • 〓猪哥哥〓

    第37楼2010/04/27

    不错的帖子,学习一下

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  • terry_tao

    第38楼2010/05/15

    好帖子!必顶!认真学习了!希望楼主再接再厉!

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  • whaisp17

    第39楼2010/07/26

    你好,我是做核酸蛋白检测仪的,目前国内做蛋白质纯化分离实验比较多,但是国产仪器普遍知道做到定性,真正达到定量还是有一段距离需要走的,有一篇关于核酸蛋白检测的说明可以分享下:http://www.wuhan17.com/whasp-Article-74254/

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  • moneygreat

    第40楼2010/07/28

    很好很好,我是新手。希望你继续发帖

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