frappuccino
第15楼2010/07/29
楼主你的文章很好!让我很有想法。
请大家一起支持这位楼主。期望更多的网友像楼主学习,勇于把自己的实验拿出来和大家讨论。
相信通过这次的讨论,楼主一定受益匪浅。
实验做得有些简单,我很多年前就见过了。
但是我要问楼主一个问题:
1.指纹图谱软件的 算法应该是根据的夹角余弦值进行计算的吧。
你仔细考虑一下,还有什么算法可以计算。比较一下两者的特点。
2.是否紫外检测法能对所关注的成分进行良好的仪器信号响应,如果没有紫外吸收的物质,是否需要考虑。
3.你的前处理方法是否 无意中除去了部分可能有意义的成分。如肽类物质,糖类物质。
提以上意见都是为了帮助楼主完善你的实验,作为学术的交流。请不要觉得有意刁难。其实这都是我之前遇到的问题,现在问我,其中的部分问题虽说有所收获,但还有些问题,也没有很好的解决办法。
也希望论坛里的网友一同集思广义。一起来讨论讨论。
Allen
第16楼2010/07/29
呵呵,您太客气了,帖子就是拿来讨论的,有思维的交流才会有大家的进步。您的问题我尝试来解答一下,如有理解不对的地方还请指出:
1.我用的是国家药典委的软件,的确是通过夹角余弦算的,而中南大学的那个软件版本应该是以相关系数法为原理的,前者主要侧重的是共有峰的相似度,而后者一般是更注重整张谱图的相似度。至于欧氏距离法,应该是更为强调物质含量方面的相似度,起指纹图谱“定量相似度”的作用。以上只是理论方面的说明,有机会还是要试一试,用数据来说明一下差别。
2.这个答案是肯定的:不能。进而也衍生出了多维指纹图谱的概念,对于性质不同的物质,没办法用一张紫外图完全的表达出来,因此可以考虑构建多种检测方式,如ELSD,GC等。
3.这个问题好像和第二个有一点点重复,前处理的条件摸索过程其实就是在尽可能保证指纹图谱保留尽可能多的指纹性,峰数越多,分离度越高,响应越强越好,最终比较下来选择最合适的处理方法。而我选择的是有机相水相溶剂一定比例混合超声(过膜是保护柱子的前提),从方法上来看好像没什么问题,倒是您说的肽类物质和多糖等,我还是建议针对他们进行专属性的检测,即便是还用紫外,前处理方面则更应该倾向于特定类别物质出峰最多的方法。