近红外光谱分析技术虽具有快速、简便、相对准确等优点，但准确性受多种因素的影响。其中，样品的粒度及均匀度影响最大，粒度变异直接影响近红外光谱的变异。在实际工作中，应该在标样的制样条件下制备被测样品，使样品具有标准化的均匀粒度，减少由于粒度引起的误差。此外，模型初建时标样选择、数量及其设计也影响到预测的准确度。标样的选择要充分考虑样品成分的含量和梯度、标样的物理和化学特性，以提高多定标效果和应用范围。标样数量若太少，不足以反映被测群体的常态分布规律，数量太多，则增加工作量。标样设计也影响定标的准确性。对于成分含量间相关性强的被测成分可根据同套样品进行定标，对相关性差的成分，可根据特定的筛选原则，分别以另外的样品进行定标，以提高定标效果及检验准确性。另外，不同温度会影响NIRS预测的准确性。NIR 对温度敏感，10～20℃就可引起吸光度发生变化，而且温度影响不呈规律性。
可采用温度全局模型方案，保证准确的近红外测试。

温度对近红外光谱的影响是很大的，因此有些高档近红外光谱仪在采样器件和仪器整体上都采取了控温措施，可以保障整台仪器在同一温度下使用，当然更主要的是可以保证所有模型都在同一温度下建立，从而很好地克服了温度带来的系统偏差。如果没有这些措施，用补充不同温度下光谱数据来扩充模型的做法应该说是不科学的，因为很难找到温度的变化和光谱能量变化之间的关系。