可以尝试一下，换一个别的缓冲体系，再看看分离效果！

其他的分离效果都不如硼砂的好~~~~真是纠结呢 ，现在又开始考虑硼砂的浓度的影响，现在遇到几个问题：
1：混标稀释前后在同一体系（硼砂硼酸）中进样，出的峰不一样，稀释后的混标少了几个峰。但是在其他非硼砂硼酸的体系中出峰情况一样。这是为什么呢？
2：为何同样浓度的硼砂，它的电流值却相差很大？前几天做的是86uA ,现在做的却变为19uA?
3:考察出一个较好的体系，可以达到基本分离，但是基线出现严重漂移，且有拖尾的现象，该如何改进和优化才可以解决上述完全问题？
请各位赐教~~~~~不胜感激！！！

嘌呤和嘧啶本来就很容易通过产生氢键发生结合，这个在非质子性溶剂中可能会得到改善，但是这些溶液的缓冲体系部分的属于非水电泳，不好做。
你的三个问题可以归结为两个问题 ，一个就是冲洗条件太弱，或者是样品溶液不稳定，导致管子有点堵，所以电流变化很大。还会有基线漂移很大的情况。
在一个是更换体系没有改善的问题，你有必要借鉴一些用CE做核酸分离的文献了，这一块没做过。