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  • xihe

    第21楼2011/12/30

    质谱当然只能做到这个样子了,反应发生在哪些位置就要把代谢产物富集出来打核磁确证位置了,复杂复杂

    bigpalewolf(bigpalewolf) 发表:我用Qtrap试着做了个S9 fraction 的代谢物分析。觉得MRM-EPI最靠谱,NL-EPI,Precusor-EPI还是能给点信息。Full scam和MS/MS/MS基本得不到啥信息。。。不知道是不是学艺不精还是本身就这个样子。

    另外,给出的结果也只能推测是发生了那些biotransformation,并不能确定氧化或者还原发生在具体的哪个位置。。。

    不知道大家是否有同样的感觉!?

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  • 胜邪

    第22楼2011/12/30

    抱歉阿,上次可能是网络问题,刚重新上传了。

    bigpalewolf(bigpalewolf) 发表:楼上的楼上上传的附件怎么打不开呢!?多谢!

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  • bigpalewolf

    第23楼2012/01/27

    多谢!已经下载。 更正一下,最近发现precusor 很强大, 尤其对于phase II met。

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  • kkeats

    第24楼2012/01/30

    感觉MRM-EPI对有些有定向裂解基团的化合物作用比较大,效果比较好,比如羟基,要么加在MS1上,要么加在MS2上,但有些天然化合物,没有定向裂解的倾向,MRM-EPI根本没法用,这样就需要EMS-EPI。

    我的感觉是,分辨率还是不够,如果分辨率再高些就好了

    LIGHTSIGHT这个代谢软件有些生搬硬套的嫌疑,要想解谱,还需要具备代谢生化知识去主动预测一下代谢产物,总之这个软件不是很好

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  • anyizhimin

    第25楼2012/01/31

    LIGHTSIGHT可以提供很多可能的代谢途径,但确实需要自行预测,因为它几乎罗列了所有可能的途径,要自行进行删减,而analyst只提供了十几种途径,自己逐条再输入很累人啊。
    EMS-EPI可以在筛选代谢物的时候用,在确定了主要的代谢物后,用MRM-EPI对这些代谢物进行相对定量,或者对其碎片着重再扫描,可以对代谢物的定性提供参考。
    四级杆的定性能力确实比较差一些,尤其是当化合物极为微量时,就做不清了,而且只能做到MS3,有些化合物结构做不清。

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  • kkeats

    第26楼2012/02/02

    请问楼上做什么的,感觉行业比较近,希望能进一步交流,我们是做药物非临床安全性评价的,我的邮箱是jixiaohu7223@163.com,希望能和您常联系。


    我目前在做一个天然产物的代谢,感觉有的时候TOF好一些,分子量越精确,目标性越强,排除的东西越多,比如用AB的四极杆,同一个碎片离子我推出了三种可能的裂解途径,但搞不清哪个对,或者都不对,很是苦恼。唉,步履维艰啊。

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  • bigpalewolf

    第27楼2012/02/29

    lightsight 的确提供了很多想不到的生物转化途径, 不过有些的确是累赘,得自己一步一步的排除掉,比如峰面积比例为0%的。。。
    我做出来的EMS-EPI TIC图的背景还是很高,不看XIC根本找不出峰。

    另外问个问题, 大家做Met ID用到的分析柱是那种?跑的梯度如何呢!?

    多谢!

    anyizhimin(anyizhimin) 发表:LIGHTSIGHT可以提供很多可能的代谢途径,但确实需要自行预测,因为它几乎罗列了所有可能的途径,要自行进行删减,而analyst只提供了十几种途径,自己逐条再输入很累人啊。
    EMS-EPI可以在筛选代谢物的时候用,在确定了主要的代谢物后,用MRM-EPI对这些代谢物进行相对定量,或者对其碎片着重再扫描,可以对代谢物的定性提供参考。
    四级杆的定性能力确实比较差一些,尤其是当化合物极为微量时,就做不清了,而且只能做到MS3,有些化合物结构做不清。

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  • jiayb141

    第28楼2012/03/29

    一般我们做MRM-IDA-EPI,灵敏度高,尝试不同子离子的MRM,互相验证补充一下,一般情况Lightsight都会找到,也可以使用precursor ion-IDA-EPI,都是互相补充验证的过程,这里面关键是对母离子的碎片分析,要有化学底子。

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  • kkeats

    第29楼2012/04/03

    楼上哪里的 可以交流一下么

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  • jiayb141

    第30楼2012/04/16

    两篇文献讲的很详细,Qtrap做代谢产物和活性中间产物检测都很强大。

    kkeats(kkeats) 发表:论坛里有用TRAP做代谢的没有?希望能给我一些指点

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