可能是温度，PH值，抽虑过程中的变化，你看看两个仪器的走流动相时的压力是否有变化，变化幅度。

那就不太好说了，压力是流速的间接反映，一般情况下，压力越高流速越大，压力越小流速越小。差了2bar到不大，也可能影响不到，也可能会影响到

考虑几个问题：
1、仪器流速
2、仪器的梯度精度
3、仪器的混合滞后（即混合器到色谱柱之间、色谱柱到检测器间的液路体积）
4、色谱柱，同一根么？
5、温度控制（看看样品有没有可能是热不稳定的呢？）
6、水

暂时想到这些

还有柱前柱后体积

应该是死体积的影响,两台仪器的型号和配置都一样吗?都是二元泵或者是四元泵吗?还有管路的内径是否都一致,还有静态混合器.如果都一致,建议测一下流速.

是用的简单的有机溶剂加水还是有缓冲盐？如果是缓冲盐的话，可能配制也有差异，包括人员、pH、称量准度等