从两种仪器的结构及荧光与拉曼产生的原理来说,两者有相似的地方,在这种情况与是不是用傅立叶拉曼,理论上来说荧光会减弱甚至消失的.

拉曼和荧光都是激发散射光，所以不加处理的原始光谱是拉曼+荧光+斯托克，关注拉曼的话，荧光是干扰，都是要把荧光除之而后快。经过FT以后，很多荧光都被扣除了。

荧光有延时，而且具有时间分辨特征，如果关注荧光这种特点，拉曼光谱是不够用的。

在荧光分析中，拉曼峰通常被用来作标志。