气相：检查低沸点、易挥发、高温不易分解的有机物，高分子难挥发的有机物可以选用裂解GC，如果把衍生GC也算上，某些极性大难挥发的有机物也能测了。
GC常见用于测：永久气体，小分子有机物，20碳以下的脂肪链及醚类、脂类衍生物、实验室常用的各种有机试剂、部分芳香化合物。

液相：理论上不适合用GC的都可以用液相测，通常由于检测器的限制（紫外），被检物必须有紫外信号，所以多用于含芳环化合物的检查。当然，只要有合适的检测器，糖类、脂类、甾体等都可以用LC测。