如果你已经尝试过pH9.3的borate buffer了，那么我个人估计这个pH 8.0 Tris也难以达到理想的结果。。。

最好的办法还是采用文献中提到的溶液，或者采用性质相近的溶液来做。做病毒的话核酸和蛋白壳体是不是容易分离？有保证壳体结构的要求吗？用SDS应该是不错的选择

MEKC模式确实常用于纯度分析及疏水性有差异的分离。不过如前所述，你还需要考虑吸附的影响。

我通过CZE分离的就是两种蛋白结构的颗粒，因此壳体结构需要保持稳定，有篇文献中提到这两种颗粒的pI值分别是3.0和3.8，缓冲液采用的是pH8.0的eCAP chiral high pH缓冲液，18kV电压118uA电流，无涂层毛细管，另外加入了SDS和腐胺作为添加剂。按照前面一大神说的pH8.0的eCAP chiral high pH缓冲液就是50mM pH8.0的Tris-HCl缓冲液。我现在的情况是除了腐胺未加、电流达不到118uA，其余条件都和文献一致，但还是很难重复出文献中的那个结果啊

有篇文献中提到这两种颗粒的pI值分别是3.0和3.8，缓冲液采用的是pH8.0的eCAP chiral high pH缓冲液，18kV电压118uA电流，无涂层毛细管，另外加入了SDS和腐胺作为添加剂。按照前面一大神说的pH8.0的eCAP chiral high pH缓冲液就是50mM pH8.0的Tris-HCl缓冲液。我现在的情况是除了腐胺未加、电流达不到118uA，其余条件都和文献一致，但还是很难重复出文献中的那个结果啊

除非是top期刊，不然口碑一般、影响因子也一般的期刊重复不出很正常的。不过也没必要非得跟文献一模一样，只要按着文献的方法做能有个大概样子就可以了，然后再在这个基础上进行各种条件的优化。当然，你能先完全按照文献的方法来试吧，有时候一些很小的方法差异都可能导致结果差异很大，因为实验的每一步设计是有其道理的。

没有做过你的那个实验，我觉得你需要再查一下那个溶液到底是什么溶液，材料里面应该会有的。还有就算是文献中的电流也很大。你不一定要和文献完全一致，能分开就行了。换个角度来看，就是分离两个蛋白颗粒，对吧？

腐胺是必须的，作用是动态涂层试剂，抑制吸附的。你不加，当然结果不对。

这个可不像炒菜，你少放一样佐料，味道也不会差太多。。。。电泳里面，少一样东西有时候就会天壤之别。

为什么你的电流这么大，是不是离子强度太高了？