应助达人

从目录中没看出什么，要么把个别名称改一下，比如第21个程序，写为“检验检测分包管理程序”

额，建议将ISO 17025里的条款对应哪份程序文件标出来，这样比较容易理清，LZ的程序文件顺序说实话，有点乱

二合一的还是单纯一个体系的？

按照17025来咯，你们有体系文件，审核一下有问题的就修改，发布新版回收旧版，如果没有建立体系文件就要重新编写、审核、发布、培训宣贯。

看了质量手册目录没问题，体系文件的目录有点乱呀，你跟着质量手册来呀，前后顺序不一致。

11.仪器设备期间核查应写成三级文件作业指导书，不同仪器的核查方法不一样，记录格式不一样，要单独写。
22.作业指导书的编写和管理程序，应改为文件控制程序，所有文件都要控制，包括质量手册、程序文件、作业指导书、计划和记录用的表格。

《实验室资质认定评审准则》
5.2.3实验室应建立并保持安全作业管理程序。
5.2.4实验室应建立并保持环境保护程序。

《评审准则》条款要求    需建立的程序文件
4.2.1    人员录用、培训、管理要求    1    人员管理程序
4.2.3    公正性、保密性要求    2    保密程序
4.2.4    人员培训与监督    3    人员培训程序
4.3.4    不相容活动的隔离    4    实验室内务管理程序
4.4.1    设施的配置要求    5    设备管理程序
4.4.5    设备停用要求    6    不符合工作控制程序
4.4.7    期间核查要求    7    设备的期间核查程序
4.4.8    设备校准要求    8    设备校准的控制程序
4.4.9    量值溯源要求    9    标准物质的溯源程序
4.5.3    诚信性、保密性要求    10/2    保持公正性、诚信度的程序
保护客户的机密信息和所有权程序
4.5.4    文件控制要求    11    文件控制程序
4.5.5    合同评审要求    12    合同评审程序
4.5.6    分包要求    13    分包控制程序
4.5.7    外部供给    14    选择和购买外部服务和供应品的控制程序
4.5.8    服务客户    15    服务客户的控制程序
4.5.9    申投诉要求    16    处理申诉和投诉的程序
4.5.10    不符合工作的处理    17    不符合工作处理的控制程序
4.5.11    纠正措施    18    纠正措施控制程序
4.5.12    预防措施    19    预防措施控制程序
4.5.14    记录    20    记录控制程序
4.5.15    内审    21    内部审核控制程序
4.5.16    管理评审    22    管理评审控制程序
4.5.17    检验检测方法    23    检验检测方法和方法确认控制程序
4.5.17.4    开发新方法    24    开发检验检测方法的控制程序
4.5.18    测量不确定度评定
利用计算机系统的要求    25、26    测量不确定度评定程序
保护数据完整性和安全性的程序
4.5.19    抽样    27    抽样程序
4.5.20    样品处置    28    检验检测样品处置控制程序
4.5.21    结果质量控制    29    检验检测结果质量控制程序
4.5.22    能力验证要求    30    参加和组织能力验证的控制程序
4.5.28    结果传输的要求    31    检验检测结果报告控制程序
4.5.31    检验检测风险识别与评估    32    检验检测活动风险评估控制程序
4.6.1    食品检验机构特殊要求       
           

目测只是单纯的CMA，手册的目录你跟着新改版准则的条款顺序改的，应该不会有问题。
至于程序，你先把新的准则中所有明确要求得有的程序识别出来，列一个列表就很清晰了。