生物质谱技术氨基酸分析仪样品用量少，而且大趋势是生物质谱技术用得会越来越多

氨基酸分析仪其实就一LC。MS和LC在蛋白质定性肯定是前者占绝对优势。

氨基酸分析仪是基于Edman降解对多肽序列进行逐个降解和分析。
生物质谱是通过多肽二级MS谱图解析进行序列判断。

正如前面楼上说所
1。氨基酸分析仪对序列长度有一定局限，但其实生物质谱也会对多肽母离子质量有一定限制，6-30个氨基酸是比较理想的情况。所以这一点上两者平手。

2。氨基酸分析仪优势：准确（可以分辨Leu,Ile)，简便（无需解谱）。
缺点：对样品浓度和纯度要求高；样品成本较高

3。生物质谱优势：对样品纯度和浓度要求相对低；样品相对成本低
缺点：无法分辨Leu/Ile；需要专业解谱软件或人工解谱（假如是denovo），而有时由于谱图质量不高，会影响最终序列的可靠性

随着生物信息学和搜库软件的发展，生物质谱可以在很少的样品对蛋白质从头测序和翻译后修饰的氨基酸，氨基酸分析仪做不到