本质上是填料(固定相)的不同,正相色谱柱填料极性强,洗脱顺序由弱到强；反相色谱柱填料极性弱，洗脱顺序由强到弱。以下是详细说明：
1、正相色谱 正相色谱用的固定相通常为硅胶（Silica）以及其他具有极性官能团胺基团，如（NH2，APS）和氰基团（CN，CPS）的键合相填料。
由于硅胶表面的硅羟基（SiOH）或其他极性基团极性较强，因此，分离的次序是依据样品中各组分的极性大小，即极性较弱的组份最先被冲洗出色谱柱。正相色谱使用的流动相极性相对比固定相低，如正已烷（Hexane），氯仿（Chloroform），二氯甲烷（Methylene Chloride）等。 2、反向色谱 反向色谱用的填料常是以硅胶为基质，表面键合有极性相对较弱官能团的键合相。反向色谱所使用的流动相极性较强，通常为水、缓冲液与甲醇、乙腈等的混合物。样品流出色谱柱的顺序是极性较强的组分最先被冲洗出，而极性弱的组分会在色谱柱上有更强的保留。 常用的反向填料有：C18（ODS）、C8（MOS）、C4（Butyl）、C6H5（Phenyl）等。 色谱的正反相是根据固定相和流动相的相对极性比较而区分的。一般情况如下： 正相色谱：固定相极性大于流动相极性：常见的色谱柱有：硅胶色谱柱、氨基色
谱柱、苯基色谱柱、氰基色谱柱等。
反相色谱：固定相极性小于流动相极性：常见的色谱柱有：C18色谱柱、C8色谱柱等。

正相体系常见的柱子有：硅胶柱、氨基柱、CN基柱和Diol二醇基柱，最普通的应该就是硅胶柱。正相柱和反相柱比，最需要注意的是水分，正相柱对水分非常敏感，流动相中水分含量的些微变化对保留时间影响很大，因此正相柱测定前平衡时间需要几个小时甚至更长。

应助达人

正相柱和反相柱比，最需要注意的是水分，正相柱对水分非常敏感，流动相中水分含量的些微变化对保留时间影响很大，因此正相柱测定前平衡时间需要几个小时甚至更长。

正相柱和反相柱比，最需要注意的是水分，正相柱对水分非常敏感，流动相中水分含量的些微变化对保留时间影响很大，因此正相柱测定前平衡时间需要几个小时甚至更长。

应助达人

反相柱用于大多数HPLC分析，主要用来做含量分析。
正相柱主要用于分离手性化合物，主要用于测试ee值，dr值等。
前者流动相一般为与水混溶的溶剂，如水-甲醇，乙腈，甚至加入无机盐配成缓冲溶液，而后者往往用正戊烷等憎水溶剂。正相柱对溶剂中的水有一定要求，过多的水会使其损坏。

通常所说的正相柱和反相柱的区分其实不是很规范，最开始的时候正相和反相是通过流动相和色谱填料的极性去区分。而现在很多的时候大家都把正相柱和反相柱定义为硅胶基质的键合柱，如反相是指C18 C8等、而正相是SI 、氨基柱、氰基柱等等。而其实很多别的类型的柱子都是在这个范围之类的， 比如手性柱有正相的手性柱、反相的手性柱，所以就单独拿出来叫手性柱，而不用正相和反相去区别。

反相柱用于大多数HPLC分析，主要用来做含量分析。
正相柱主要用于分离手性化合物，主要用于测试ee值，dr值等。

前者流动相一般为与水混溶的溶剂，如水-甲醇，乙腈，甚至加入无机盐配成缓冲溶液，而后者往往用正戊烷等憎水溶剂。正相柱对溶剂中的水有一定要求，过多的水会使其损坏。

正相柱和反相柱比，最需要注意的是水分，正相柱对水分非常敏感，流动相中水分含量的些微变化对保留时间影响很大，因此正相柱测定前平衡时间需要几个小时甚至更长。

谢谢积分！

现在一般用的都是反相柱