2019年5月25-26日,由中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业青年工作委员会、中国生物化学与分子生物学会糖复合物专业青年工作委员会主办,复旦大学承办的2019年临床蛋白质组学和糖组学学术研讨会在复旦大学枫林校区顺利召开。
会议旨在促进我国蛋白质组学、糖组学领域的合作交流,加快蛋白质组学、糖组学在精准医学中的应用。
复旦大学陆豪杰教授作为大会主办方代表为大会作开幕致辞。
大会现场
陆豪杰 复旦大学
作为大会的特邀嘉宾,复旦大学杨芃原教授作题为《疾病糖蛋白质组的定量质谱》的报告。在回顾科技技术发展有助科学研究的部分时,杨芃原特意提到SCIEX的SWATH数据非依赖采集技术。而在提及对未来蛋白质技术的展望时,杨芃原老师对MRM技术抱有很高的期望。
SCIEX展台
大会第一天,西湖大学郭天南教授为与会者带来题为《SWATH/DIA 临床应用的最新进展》的报告。郭天南老师介绍了最新在TripleTOF 6600与Microflow微流色谱上做的快速高通量临床蛋白组学创新方法S3-SWATH (Single-shot short-gradient SWATH),可以将蛋白组分析时间从2个小时缩短到22分钟,每天最多可以分析60-70个样品,单个样本中可以鉴定4000+个蛋白,适合临床大队列样本分析,并有效降低分析成本。
最后,郭天南老师介绍西湖大学蛋白质组大数据实验室与新英格兰医学杂志联合主办的第一届西湖-新英格兰 临床蛋白质组大数据暑期培训班”,将于6月28-29日在西湖大学校区举行(倍道而进|第一届西湖-新英格兰 临床蛋白质组大数据暑期培训班)。课程将对临床队列样品蛋白质组学的实验设计、临床样品的半自动化批量制备、SWATH质谱分析、MRM/MRM-HR靶向分析、数据统计分析、可视化、机器学习寻找生物标记物等进行全方位的讲解和上机实践(包括电脑软件、计算机集群实操、压力循环仪实操和质谱实操)。
郭天南 西湖大学
SCIEX应用技术专家陈晨博士作题为《Microflow-SWATH,让临床蛋白质组学不再困难》的报告。报告主要分为快速稳定的Microflow液相系统和Microflow-SWATH轻松实现高通量临床蛋白组两部分。重点突出了匹配临床应用的蛋白组学方法关键点:1. 微流液相匹配临床大队列分析通量,方法更加皮实耐用;2. SWATH可以完整保留样本中所有肽段信息,用于发现到定量不同目的处理,二级定量特异性和灵敏度好。目前这套方案已经在国内外知名的临床研究机构开展应用,包括ProCan 澳大利亚癌症蛋白质组中心拥有6台SCIEX 6600 Triple TOF,工业流水线式样本采集和大数据处理;以及华西医院使用SCIEX 5600+ Triple TOF和Microflow-SWATH技术,癌症及癌旁样本共计进样128针共鉴定6500个蛋白的实例。
陈晨 SCIEX应用支持专家
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