其他null检测 | 使用ProSightPD进行top-down蛋白质鉴定-赛默飞色谱与质谱

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应用领域	生物产业
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使用ProSightPD可对复杂蛋白质混合物进行自动化的高通量top-down蛋白质组学研究。仅用5 µg蛋白，即可鉴定到大肠杆菌核糖体蛋白复合物中超过90%的组成蛋白。得益于Orbitrap质谱的高分辨率和高质量串联谱图，ProSightPD可精准测定蛋白质序列、蛋白翻译后修饰类型及位点。这一工作流程可用于蛋白复合物的组成研究和翻译后修饰研究等，与bottom-up和native MS等蛋白质组学技术互为补充，提供更加全面的蛋白质结构信息。

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当前，蛋白质组学主要有两类研究策略，即基于分析酶解后多肽的bottom-up（自下而上）蛋白质组学和直接研究完整蛋白的top-down（自上而下）蛋白质组学。由于完整蛋白质的分离和串联质谱解析相对于多肽难度更大，top-down蛋白质组学的进展相对缓慢。随着MabPac RP等分离完整蛋白的高性能色谱柱的出现及Orbitrap超高分辨质谱技术的不断发展，快速批量获取完整蛋白质的高质量串联质谱图逐渐成为可能。赛默飞世尔科技业界领先的top-down蛋白质组学数据分析软件ProSightPD也使研究者可以采用类似bottom-up蛋白质组学的方法，高通量鉴定top-down串联质谱图。本文的工作中，我们以大肠杆菌核糖体的蛋白质组成分析为例，对top-down蛋白质组学技术以及ProSightPD工作流程进行了考察。

使用ProSightPD可对复杂蛋白质混合物进行自动化的高通量top-down蛋白质组学研究。仅用5 µg蛋白，即可鉴定到大肠杆菌核糖体蛋白复合物中超过90%的组成蛋白。得益于Orbitrap质谱的高分辨率和高质量串联谱图，ProSightPD可精准测定蛋白质序列、蛋白翻译后修饰类型及位点。这一工作流程可用于蛋白复合物的组成研究和翻译后修饰研究等，与bottom-up和native MS等蛋白质组学技术互为补充，提供更加全面的蛋白质结构信息。

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文献贡献者

赛默飞色谱与质谱

钻石会员丨第23年

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