在前几期中,我们更新了4篇单四极质谱使用小贴士:(I)采集和处理SIR(2D)和MS all Scan(3D)数据(II)结合紫外谱图查看相关质谱信息(III)查看信噪比并对谱图进行平滑(IV)如何理解含噪TIC图的成分检测算法(CODA) 。
本期,我们来看下Empower中针对QDa的质量分析窗口(Part1)。
第1步:
质量分析窗口用于查看和分析PDA和MS,单个结果的数据。我们首先来看下窗口中的默认图(见下图)。
显示了每个集成峰的紫外和质谱顶点。
显示紫外色谱图。
显示MS TIC图。在这个例子中,有一个正扫描和一个负扫描,两者的TIC图是重叠的。
显示了每个峰在较高响应极性的突出质量的提取离子色谱(XIC)的叠加。
这些谱图查看都是非常实用的。
第2步:
从“光谱视图”菜单中选择“组合”,显示每个积分峰的MS顶点谱图和MS峰内合并的质谱图(见下图)。
第3步:
合并的质谱图是峰内一部分质谱图的平均,它可提高信噪比。可通过“峰高%阈值”来确定选取哪部分质谱图进行合并。该阈值在“处理方法”的MS 3D通道选项卡上设置(见下图)。如果我们将其设置为0,则 Empower使用从峰起点到峰终点的所有光谱图。如果我们将其设置为30,则Empower使用峰高30%的光谱(创建新处理方法时的默认值为10)。
第4步:
从“光谱视图”菜单中选择“纯度”,显示每个积分峰的UV和MS的前沿光谱、顶点光谱和后缘光谱(见下图)。
第5步:
可以用这种方法来考察峰的均一性。Empower获取前沿和后缘光谱的点由“处理方法”的“MS 3D通道”选项卡上设置的“Leading Spectra Extraction Point (%)”和“Trailing Spectra Extraction Point”确定。如果我们将Leading Spectra Extraction point设置为0,则Empower在峰起始时获取光谱。如果我们将该值设置为30,则从峰值开始到峰值保持时间的30%取合并谱。后缘光谱提取点也是如此(见下图)。
注:如前面的第4步所示,1.2分钟处第二个峰,其前沿光谱、顶点光谱和后缘光谱各不相同。这些信息都为判断峰纯度提供了重要依据。
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