应用新型扫描型四极杆的DIA法进行系统生物学研究的方法优化

2017/03/27   下载量： 4 次

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SONAR是一种新型DIA操作模式，可同时提供定性和定量信息，被应用于混合型四极杆/飞行时间(Q-ToF) MS。本文阐释了其采集原理，然后介绍了如何通过优化分析参数(例如上样量、扫描四极杆分离窗口、扫描速度和依赖m/z范围的碰撞能量梯度)在复杂蛋白质组学样品的分析中获得最佳的定性和定量覆盖率。此外还从样品消耗量的角度详细研究了这些参数对定性和定量性能的影响。我们采用发现和靶向信息学工具分析和评估了来自大肠杆菌(E.coli)、血浆和两个人类细胞系的复杂蛋白质酶解样品。

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SONAR是一种新型DIA操作模式，可同时提供定性和定量信息，被应用于混合型四极杆/飞行时间(Q-ToF) MS。本文阐释了其采集原理，然后介绍了如何通过优化分析参数(例如上样量、扫描四极杆分离窗口、扫描速度和依赖m/z范围的碰撞能量梯度)在复杂蛋白质组学样品的分析中获得最佳的定性和定量覆盖率。此外还从样品消耗量的角度详细研究了这些参数对定性和定量性能的影响。我们采用发现和靶向信息学工具分析和评估了来自大肠杆菌(E.coli)、血浆和两个人类细胞系的复杂蛋白质酶解样品。

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文献贡献者

沃特世科技（上海）有限公司(Waters)
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