有没有想象过,
我们可以预测 COVID-19 在何时何地爆发?
不仅能预测到病毒的轨迹,
还可以知道会在何时何地会出现一波阳性病例!
这正是丹尼娜·西蒙斯
在加拿大安大略理工大学所研究的项目。
疫情可预测,究竟是如何做到的?
这位生物学助理教授分析了来自安大略省达勒姆地区的废水样本,寻找 SARS-CoV2 的踪迹,以确定引起 COVID-19 的病毒是否可检测到,并能预测人群中的 COVID 峰值。她的早期研究结果显示,在该地区报告阳性病例出现同样的峰值前大约 10 天,废水中的病毒也会出现峰值。
“如果这能被证实,你可以把它看作是一个早期预警信号。” 丹尼娜在谈到测试方案时说,该方案使用安捷伦液相色谱-四极杆飞行时间质谱仪(LC/Q-TOF-MS)来测量表明研究环境中存在丰富 SARS-CoV2 的蛋白质。
当丹尼娜所在的部门在 2019 年底做购买仪器计划时,她还完全没有利用安捷伦翻新的二手气相色谱质谱系统来进行疫情预测实验的想法。她之前曾计划用这台仪器来测量鱼蛋白质和代谢物中环境污染物的水平,然而所需的新仪器并不在大学预算之内。
随着安捷伦官方认证翻新仪器的推出, 丹尼娜教授的购买计划变为可能。这项计划从用户的实验室购回旧仪器,送回安捷伦工厂进行升级和翻新后再次转售,为客户提供了更全面的选择,而且这不单加强了产品管理,更可以利用回收资源, 变得更为环保。
翻新仪器价格打折
服务品质却从未打折
虽然是翻新仪器价格上获得更大优惠, 但是给客户的质量或服务支持的的要求没有降低, 。“这完全是因为能负担得起。”丹尼娜说,“这是大学的决定,购买翻新仪器。” 该大学还购买了另一台经翻新认证的二手气相色谱质谱仪(GC/MS),并计划在未来利用该计划购买一台液相色谱三重四极杆质谱仪(LC/QQQMS)。
接受挑战的同时,成功的关键在哪里?
事实上,当仪器到达时,丹尼娜的任务不仅仅是研究鱼的蛋白质。安大略理工大学董事会的一位成员分享了澳大利亚正在进行的 SARS-CoV2 废水分析的报告,并建议研究人员也这样做。
丹尼娜很快就接受了这个挑战并有自己的想法,她把所做的研究主要集中在测量废水中SARS-CoV2 核糖核酸(RNA)的存在。
图片由丹尼娜·西蒙斯提供。
“我认为如果能测量 RNA,就应该能够测量蛋白质,因为蛋白质通常比 RNA 更丰富,也更稳定,” 丹尼娜解释说。
她的研究在 9 月开始,对安大略省五个城市阿贾克斯、克拉灵顿、皮克林、大川和惠特比的废水处理中心的样品进行分析。
在样品被沉淀和离心后,剩余的半固体被分解成肽,或更小的氨基酸链。然后,丹尼娜使用 LC Q-TOF MS 测量这些肽及其序列的质量,然后将其映射到已知的基因和蛋白质序列,包括 SARS-CoV2 病毒的序列。
丹尼娜说,“大多数研究人员只是在寻找 SARS-cov2rna 或棘突蛋白,即将病毒与人类细胞结合的棒状突起。这种检测方式只是增加了检测的数量而已,而我所采用的方法更有可能让公共卫生官员有时间为特定地区的 COVID-19 疫情做好准备。废水分析的好处还不止于此。”
丹尼娜说:“我们发现了一两种与感染有关的人类蛋白质,而不是病毒性的,但仍需进一步研究。”。她补充说,“这种方法有可能超越 COVID-19,这表明废水可以扫描其他类型的病毒。”丹尼娜说,“如果这一点证明是成功的,那么政府(美国)可以从实验的结果中吸取经验与教训,我们可能会看到未来在疫情监测方面的变化。”。
安捷伦官方认证翻新仪器计划
是促成这项工作的唯一原因
丹尼娜说,“这一切都是安捷伦官方认证翻新仪器计划促成的。该计划是我的团队能够完成这项工作的唯一原因,因为如果没有这项计划,我们就无法购买安捷伦 LC/Q-TOF-MS。我相当满意!”
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