AMTK工作站自动化解决方案 应用于—病原微生物检测

2019/09/11   下载量： 5 次

方案摘要

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应用领域 医疗/卫生
检测样本 其他
检测项目 生化检验>病原微生物
参考标准 病原微生物检测

病原微生物检测市场的急剧增长，病原微生物高通量检测技术的也随之快速推进，为了适应未来发展需求，AMTK推出一系列的自动化工作站整合方案，主要分布在荧光-QPCR检测以及NGS检测这两大应用领域，整个流程方便快速、结果精确、污染率低、自动化程度高，很好的服务于病原微生物的高通量分子诊断的客户

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配置单
方案详情

进入21 世纪以来,感染性疾病仍然是危害人类健康的重大隐患,尤其是第三世界国家。WHO 宣布近30 年来,新发现了29 种新病原体。目前的现状是造成感染性疾病的微生物种类日益复杂,常见病原微生物的威胁不仅没有消除,而且出现了一些耐药性菌株,如葡萄球菌、肠球菌、铜绿假单胞菌、大肠杆菌等,加之一些新病原体的出现,给临床诊断和治疗带来了很大的困难。2003 年SARS 引起了全球性灾难和恐慌,近年又接连发生禽流感爆发、猪链球菌和牛炭疽感染人类事件,出现次数越来越频繁等严峻的现实，给病原微生物的检测和诊断提出了更高的要求，随着整个病原微生物检测技术的不断发展，从病原体水平，深入到分子水平、基因水平，如PCR技术、基因芯片技术等。这些技术通过自动化完成检测，耗时短，准确性和灵敏度都很高。这样的现代生物科学技术能够对病原微生物做出及时的诊断和鉴定，可大大减少人类对其感染的致病率和死亡率。

病原微生物检测市场的急剧增长，病原微生物高通量检测技术的也随之快速推进，为了适应未来发展需求，AMTK推出一系列的自动化工作站整合方案，主要分布在荧光-QPCR检测以及NGS检测这两大应用领域，整个流程方便快速、结果精确、污染率低、自动化程度高，很好的服务于病原微生物的高通量分子诊断的客户

应用一：病原微生物-QPCR检测

QPCR应用背景: 实时荧光定量PCR是一种成熟的核酸快速检测技术 目前已经被广泛应用于传染性疾病病原体的快速检测, 为传染性疾病的诊断提供实验室诊断依据。实时荧光定量PCR已经被应用于病毒的定性检测, 病毒各基因型和基因亚型的分型检测, 类似病毒之间的鉴别检测, 用于提供传染性疾病的临床诊断证据, 了解病毒的流行状况, 监测病毒的流行型别, 发现病毒传染源, 对于制定有针对性病毒性传染性疾病的防控策略和措施具有重要意义。实时荧光定量PCR技术能够检测感染患者和动物组织、体液样本的病毒载量, 检测病毒耐药突变体以及患者体内的感染标志物等, 对于监测患者体内病毒的耐药状况, 跟踪治疗进程, 评估疫苗预防效果或药物治疗效果等具有重要的临床意义。

方案1：高通量HPV/HBV/EB---QPCR检测自动化方案

该方案可完成96-192 个样本的HPV/HBV/EB等检测

1、QPCR检测HPV/HBV流程图：

2、工作站配置

 

 

 

配置列表

通量

96-192 sample/run/套

完成流程

LH1406

QPCR mix 试剂配置 ，QPCR样本点板

LH1209

试剂分装，提取，纯化



 

3、实验数据案例

（1）EB病毒QPCR检测数据。16个样本多次提取，手工和工作站数据对比,手工1次，工作站平行3次实验数据）

 

数据显示：EB病毒的自动化提取效果与人工提取无显著差异，样本浓度达到测试要求.

（2）HPV病毒QPCR检测结果

QPCR 检测结果

样 本 

分 组 

HPV

IC

原 液 

10-1 

10-2 

10-3 

10-4 

原 液 

10-1 

10-2 

10-3 

10-4 


样本1

A3

23.93

27.40

31.53

34.95

Undet.

24.18

27.59

31.41

35.35

Undet.


PN3

23.71

27.45

31.93

35.06

Undet.

24.14

27.69

31.79

35.29

Undet.


样本2

A4

23.93

27.51

31.14

34.43

Undet.

23.46

27.07

31.06

34.62

37.31


PN4

23.91

27.70

31.57

34.67

Undet.

23.35

27.05

31.15

34.32

36.89


数据显示：实验组 A3、A4 余对照组PN3、PN4 提取浓度相当，无显著差异。

方案2：原管上样HPV/HBV/EB---QPCR检测自动化方案

该方案可完成32-96 个样本的HPV/HBV/EB等检测

1、QPCR检测HPV/HBV流程图

 

2、主机配置

 

 

3、实验数据案例:

（1）32个样本原管上样-HPV-核酸提取检测数据

样本

DNA浓度

260/280

样本

DNA浓度

260/280

样本

DNA浓度

260/280

样本

DNA浓度

260/280

1

50.6

1.72

9

47.4

1.71

17

62.8

1.74

25

43.8

1.83

2

49.2

1.81

10

42.7

1.79

18

64.4

1.72

26

36.5

1.76

3

34.2

1.77

11

37.5

1.78

19

65.5

1.75

27

65.2

1.8

4

83.6

1.89

12

38.4

1.76

20

46.2

1.77

28

56.2

1.84

5

44.4

1.84

13

73.8

1.81

21

45.5

1.79

29

36.4

1.72

6

44.9

1.73

14

47.3

1.8

22

39.8

1.74

30

32.7

1.77

7

40.9

1.87

15

50.6

1.75

23

35.2

1.8

31

36.5

1.83

8

43.4

1.83

16

38.9

1.83

24

43.6

1.77

32

35.2

1.73

数据显示：自动化与手动定量QPCR结果无明显差异，数据准确率较高。

应用二：病原微生物-NGS检测

NGS-应用背景：对疑似感染标本采集提取后直接进行高通量测序，通过病原微生物专用数据库比对和智能化算法分析，获得疑似致病微生物的种属信息，并提供全面深入的报告，为疑难危重感染提供快速精准诊断依据，促进抗生素类药物合理使用。

方案3： NGS-提取-文库构建全流程自动化方案

该方案可完成1-32 个样本的病毒微生物-NGS检测

1、病原微生物NGS检测流程图：

 

2、工作站配置

 

3、实验数据案例 :

（1）16个样本建库后的手动和自动化工作站QPCR数据对照

 

数据显示：自动化与手动定量QPCR结果无明显差异，数据准确率较高。

结语：无论是病原微生物的QPCR还是NGS-二代测序的高通量检测，奥美泰克提供大量的样本前处理的自动化解决方案，帮助客户替代繁琐的手工操作，不仅大大缩短了样本处理和文库构建的时间，保证了样本结果的均一性和准确性。同时整个工作站可以选装的过滤系统和紫外灯消毒系统大大减少外援污染物，保证测试数据的真实性和可靠性。未来，奥美泰克随着病原微生物高通量的自动化需求不断增长，将整合更多智能的自动化功能：扫码、液位探测、离心，血浆分离等，将优质、高效、性价比高的自动化检测技术带给更多的使用者，


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文献贡献者

北京奥美泰克科技发展有限公司
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