型号: | Fragment Analyzer™ |
产地: | 美国 |
品牌: | AATI |
评分: |
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1. Fragment AnalyzerTM系统应用背景及优势
传统琼脂糖凝胶电泳由于其简单、重复性好、操作简单和易清洗,一直以来受到广大实验室的普遍青睐,但事实上传统凝胶方法无法分析长度小于50bp的DNA片段。由美国AATI公司生产推出的新一代Fragment AnalyzerTM全自动毛细管电泳系统,可以用于分析任意种类的dsDNA片段,包括普通PCR产物,多重PCR产物以及限制性酶切产物,微卫星序列SSR等。Fragment AnalyzerTM系统分离片段具有以下优势:分辨率更高(分辨率高达2bp);精确度更高(片段长度分析误差≤5%);分析通量高,可一次分析高达288个样品;分析时间减少,PCR产物可直接上样,无需进行预处理。
2.Fragment AnalyzerTM系统SSR分析优势
● 全自动 分离胶和样品自动上样,无需手动灌胶,避免交叉污染
● 高通量 可一次检测12或96个样品,最多为288个样品
● 高分辨 分辨率为2bp
● 高灵敏 检测最低浓度可达5pg/ul
● 运行快 15min内完成700bp片段分离
● 成本低 无需芯片,毛细管可反复利用
● 易操作 PROSize2.0软件直观显示分析结果
● 用途广 可分析片段范围为35-40000bp
● 更灵活 可提供12和96两种型号的毛细管列阵
3. Fragment AnalyzerTM系统应用示例
应用示例1:SSR片段分离更快速,分辨率更高
SSR样品来自不同的植物科学研究所;A、C为Fragment AnalyzerTM系统下数字凝胶成像图,B、D为与之相对应的传统凝胶电泳成像图;Fragment AnalyzerTM系统提供明显提高的分辨率和关于样品条带分析的更多细节。
应用示例2: SSR片段分离,分辨率更高达2bp
Fragment AnalyzerTM系统下,父代1,父代2以及杂合体SSR样品分离;113bp,115bp,122bp三个不同的DNA片段被精确分来,显示Fragment AnalyzerTM系统高达2bp的分辨率;片段大小由PROSize2.0软件计算,误差在预期片段的1%之内。
应用示例3:SSR片段分离更快速,15min内完成700bp片段分离
快速分离父代1,父代2和杂合SSR样品。DNA片段大小为313bp和423bp(与10%误差相一致)。外部的峰代表200bp/700bp的Marker,较高的700bp Marker的迁移时间为13min。
Fragment AnalyzerTM 12或96的技术参数
1.主要用途:
1.1 用于高通量动植物基因组核酸扩增产物微卫星片段大小分析,即SSR分析。
1.2 用于农业育种反向遗传学辐射或化学诱变突变体筛查,即Tilling分析。
1.3 用于常规DNA/RNA或扩增产物片段大小定性定量分析。
1.4 用于二代测序(NGS)过程中基因组DNA及文库的质控(定性定量)。
1.5 RNA定性定量分析。
1.6 质粒DNA分析、CAPS/RAPD/AFLP分析。
1.7 同时具备定性和定量的功能。
2.工作条件
2.1 环境温度: 15到25°C
2.2 电源:100-240 VAC, 50-60Hz
2.3 湿度:小于80%
3.技术指标
3.1 *自动进样系统标准要求:标准SBS格式96孔板装载样品,96个样品同时进样,同时检测。
3.2 *进样系统配置要求:3x 96样品进样托盘,可实现无人值守下288个样本连续进样定性分析或384个样本连续进样定量分析。
3.3 *毛细管电泳分离技术,96通道毛细管长度1375px或者2000px。片段大小分辨率2bp(小于300bp片段)
3.4 全自动仪器,每次标本分析都更换新的分离胶。
3.5 分析前全自动灌胶。
3.6 全自动进样。
3.7 全自动进Marker和Ladder。
3.8 分析结束后全自动清洗毛细管。
3.9 分析结束后全自动将毛细管置入毛细管保存液中。
3.10 标准分析时间:15分钟内完成96个样本的分析检测(小于3kbp样本)
3.11 *检出限:5 pg/μL,即2ul上述单组分标本稀释12倍后进样,可测出信噪比大于10:1的信号。
3.12 动态范围:从最小至最高优于3个数量级。
3.13 样品要求:PCR产物、基因组DNA、RNA等。样品无需纯化除盐等后处理,直接进样分析。
3.14 *可检测DNA范围:35~100000bp。最大可测到10万碱基对,可对gDNA基因组DNA进行质控检测。
3.15 *突变检测灵敏度:可检测1000bp大小的DNA片段中1个碱基突变的存在以及8个混合样本中1个突变样本的存在。
3.16 适用的试剂盒:基因组DNA,NGS,RNA及常规片段大小分离试剂盒。
3.17 片段大小计算精度:优于5%,
3.18 光源:长寿命LED光源(标准寿命超过10年)激发波长470nm。
3.19 *检测器:高灵敏度CCD检测器,检测样本的发射波长范围:500~600nm。
3.20 具备电压进样和真空进样2种进样方式。
3.21 可同时放入2种不同类型的分离胶,2种不同类型的应用可不需要人工干预连续进行,如可连续进行DNA和RNA定性定量分析。
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