oligo Array高通量外显子捕获引物池芯片合成系统

1. 应用背景
全基因组外显子捕获和目标测序外显子捕获，是二代测序中的重要应用，这需要一次性合成几十至几百万条引物，传统的引物合成是无法实现的，全世界的合成仪全部运转起来，也无法完成该项工作
OligoArray芯片式合成仪的出现解决了该问题，OligoArray可以一次性合成几十万条引物并做成OligoPOOL，几十万条引物在一个管中，这样，在二代测序时，就可以在有限容量的芯片中，进行有针对性的目标序列进行深度测序。得到质量更好的数据。



2. OligoArray工作原理
将基因芯片放入合成仪中，合成仪控制芯片中每一个合成池的电极电位，在芯片上（一般为12000或者94000个合成池，即可同时合成12000或者94000个DNA的芯片），按照软件设计的DNA序列，合成一定长度的DNA，由待合成引物的3’端向5’端合成，相邻的核苷酸之间通过3'→5'磷酸二酯键连接，由此合成所需要的DNA/RNA。合成后的大量DNA从芯片上剪切下来，即单管中就会含有几万条引物，用于二代测序等工作。
 



3. OligoArray的主要功能及应用范围
· 高通量DNA合成
· 基因合成
· 全基因组外显子捕获引物合成
4. OligoArray技术参数：
· 在芯片上的原位式电化学Oligo合成。
· 可同时装载1～8张芯片，芯片规格：12K，94K。
· 单次最多合成8x94000个Oligo
· 单次运行时间：小于24小时
· 合成规模：每个Oligo合成量小于1pMole
· 6个标准Amidite接口，6个试剂瓶位，隔离罩防潮保护
· 电化学去保护
5. OligoArray技术要求
· 一次合成最多8 x 94,000条Oligo，24小时内即可完成，
· 平均每个合成循环的时间约为40分钟（每延伸一个碱基的反应为一个循环）
· 每个Oligo的合成规模在0.1pMol左右，
· 可合成最长达200mer的Oligo。
· 8个合成池。
· leave it on模式。
· 有6个单体瓶位和7个试剂瓶位
· 使用常规单体/修饰单体和试剂进行合成
· 电化学方法去保护，采用选择性去保护方法，只将需要延伸的Oligo进行去保护反应，随后进行合成反应。
· 芯片可以在单色或者双色荧光Reader上进行扫描。
· 合成的Oligo可以Leave on chip 或者剪切下来做成Oligo Pool