1. 在环境监测方面的应用
环境监测数据是进行环境科学研究和制定环境战略、政策和规范的基础资料与依据。环境研究中经常关注的一些元素正是原子吸收光谱分析法所擅长测定的元素。因此，
原子吸收分光光度计在环境监测方面获得了相当广泛的应用。
（1）水环境的监测
原子吸收分光光度计广泛应用于水环境中重金属的监测。例如，可以采用FAAS单标准连续稀释校正法测定了水样中的镁，免除了标准系列的配制，提高了分析速度；测定水环境中Cu、Cd、Pb和Zn的含量；采用STPF（StabilizedTemperaturePlatformFurnace恒温平台炉）技术能够分析海洋悬浮物Cu、Pb、Cd的化学状态，测定它们在可交换态、碳酸盐结合态、铁锰氧化物态、有机硫化物态和残渣态中的含量。
（2）大气环境质量分析
例如，用一定气孔性石墨探针收集大气中的微粒物质，采用GFAAS直接测定样品中的铟和镉，方法简便、灵敏。
（3）土壤和固体物分析
用GC-GFAAS测定土壤中的铅、镉；用FAAS法测定土壤中的铜、锌。
2. 医学卫生方面的应用
人体内的微量元素含量很低，但在保持人体生命活力方面，微量元素与人类健康有着密切关系。它们的摄入量过多或不足都会不同程度地引起人体生理的异常或发生疾病。原子吸收分光光度计能够检测微量元素，其监测结果是辅助医疗诊断的重要资料。
例如，用原子吸收光谱法检验微量元素简便快速，已用来测定铬、锰、铜、锌、铁、钙等。血液基体复杂，使用基体改进剂能更有效地进行测定。用脉冲进样技术火焰原子吸收光谱法能够测定血清中的结合态与非结合态锌。
3. 食品分析方面的应用
原子吸收分光光度计在农产品分析方面应用也很广，例如，能够用来测定大米中的铜，玉米粉中的钴，镁和镉，大米、茶叶和蒜头中的硒。微量进样测定松花蛋中的铅。原子吸收分光光度计也常用来测定饮料和营养品中的微量元素。
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