在使用气相色谱仪毛细管系统分析时首先要应用百分之九十九点九九以上的N2为载气。对长时间使用的毛细管系统除了定期检查柱子老化之外，还需要对玻璃内衬管定期清洗。
色谱仪汽化室系统的清洗步骤：
1、把散热帽取下，再取下导向器和T型硅胶垫。
2、用两个M22的扳手取下螺母拉出密封板，再检查耐温密封圈的外观若已损坏应更换。
3、取出隔热清洗器体再取下毛细管柱的入口螺母。
4、使用镊子取出玻璃衬管，在衬管上带有压垫护套和Ф4.8的石墨垫将其与衬管分离。
5、用可溶解试样样品的溶剂清洗衬管。重点清洗衬管内壁和内径中的微粒。
6、清洗后要按照卸下的相反顺序安装好汽化室系统。注意要用两个M22的扳手用力压紧螺母，而整个汽化室系统要检漏气，完全正常后重复安装上毛细管的柱入口。
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