分子杂交仪基本原理--上海比朗为你解答

  比朗解答分子杂交仪分子杂交基本原理: (一)DNA变性: DNA变性是指双螺旋之间氢键断裂,双螺旋解开,形成单链无规则线团,因而发生性质改变(如粘度下降,沉降速度增加,浮力上升,紫外吸收增加等)。 1、DNA变性的方法: 1)加热; 2)改变DNA溶液的pH; 3)有机溶剂(如乙醇、尿素、甲酰胺及丙酰胺等)等理化因素。

  2、增色效应:DNA在260nm处有最大吸收值,这一特征是由于含有碱基的缘故。在DNA双螺旋结构模型中碱基藏于内侧,变性时由于双螺旋解开,于是碱基外露,260nm紫外吸收值因而增加,这一现象称为增色效应(hyperchromic effect)。利用DNA变性后波长260nm处紫外吸收的变化可追踪变性过程。

  3、溶解曲线:如果升高温度使DNA变性,以温度对紫外吸收作图,可得到一条曲线,称为溶解曲线。

  4、融解温度:通常人们把50%DNA分子发生变性的温度称为变性温度(即熔解曲线中点对 分子杂交 2 应的温度),由于这一现象和结晶的融解相类似,故又称融点或融解温度(melting temperature, Tm)。因此Tm是指消光值上升到最大消光值一半时的温度。

  5、影响Tm值的因素:Tm不是一个固定的数值,它与很多因素有关: 1) 部因素:pH、离子强度。随着溶剂内离子强度上升,Tm值也随着增大。 2) 部因素:DNA的碱基比例、DNA的均一性;在相同条件下,DNA内G-C配对含量高,其Tm值也高。

  6、DNA中的GC含量与Tm值关系: Tm = 69。3 0。41 × % (G C) 对于小于20bp的寡核苷酸,Tm=4(G C) 2(A T) 实验表明DNA分子中(G C)克分子含量百分比的大小与Tm值的高低呈直线关系。 (二)复性:变性DNA只要消除变性条件,二条互补链还可以重新结合,恢复原来的双螺旋结构,这一过程称为复性(renaturation)。 退火:通常DNA热变性后,将温度缓慢冷却,并维持在比Tm低25~30℃左右时,变性后的单链DNA即可恢复双螺旋结构,因此,这一过程又叫做退火。 复性后的DNA,理化性质都能得到恢复。倘若DNA热变后快速冷却,则不能复性。 影响复性速度的因素: 1、DNA浓度:愈高,复性速度也愈快。 2、DNA片段的大小:DNA片段愈大,扩散速度愈低,使DNA片段线状单链互相发现互补的机会减少。因此,在复性实验中,有时将DNA切成小片段,再进行复性。 3、温度:过高不利于复性。 4、溶液的离子强度:通常盐浓度较高时,复性速度较快。 5、DNA顺序的复杂性;简单的分子复性很快,如polyd[T]和polyd[A]由于彼此互补识别很快,故能迅速复性。但顺序较复杂的DNA分子复性则较慢。因此通过变性速率的研究,可以了解DNA顺序的复杂性。

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