《自然》：如何消除基因数据的不一致

2013/05/18   下载量： 1 次

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《自然》：如何消除基因数据的不一致 来自美国范德堡大学的研究人员发表了题为“Inferring ancient divergences requires genes with strong phylogenetic signals”的文章，针对不同基因树之间存在的不一致性展开了探讨，指出要消除不一致性需要的两大依据。这一研究成果公布在5月16日的Nature杂志上。 领导这一研究的是范德堡大学Antonis Rokas博士，其研究组主要研究方向是基因组系统分类，曾参与研究报道称，生物进化并没有选择特殊蛋白的偏好密码子。 虽然第一个基因组是在10年前的测定，但是基因组已经对系统分类有了很大的影响。基因组数据使研究人员发现了建立生物之间早期关系的新的标记。大量的数据给系统分类建设的推断以更多的信心，但也带来了挑战。研究人员需要更大的计算机和新的统计算法来处理这些数据。有些棘手的问题也变得更清楚，包括某些基因历史看起来更像进化网络而不是树。比较基因组学将使可以得到的分子数据极大地增加，从而在组建一个更清晰的生命之树上起关键作用。 为了解决不同基因树之间存在的不一致性问题，在这篇文章中，研究人员对来自23个酵母基因组的1,070个同源基因进行了系统基因组分析，发现这1070个基因树中与从级联分析得到系统亲缘关系均不一致。而且这种不一致性会随着系统更深入，节点更短，而程度更大。

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