在药品质量控制中，控制水活度可以恶化微生物的生长环境、抑制微生物的繁殖，但是必须指出其中的微生物依然存在。当药品所处的环境发生改变（比如一些非独立包装的药品暴露在一般环境中时），水活度会提高，微生物会开始增殖导致药品污染。在美国药典中，USP1112就是水活度在非无菌产品监测上的应用，因为无菌药品中不允许微生物存在即使是休眠的。
从终产品风险控制的角度来说，如果药品的水活度在0.90以上，微生物污染的风险就有细菌、霉菌和酵母；如果在0.77-0.90之间，霉菌和酵母污染的几率更大些，但是要关注金黄色葡萄球菌的存在；如果在0.77以下甚**0.6以下，微生物污染的风险就相应变小，完全可以减少常规测试的项目。
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