快速精准肿瘤基因组分析软件

上海高创化学科技有限公司

2014/04/14 10:45

日前，来自美国梅奥诊所（Mayo Clinic）的研究人员设计了一款可识别肿瘤基因改变的软件——BIMA V3（Binary Indexing Mapping Algorithm，version 3），比其他常用基因测序程序速度快20倍，准确度高 25%。该研究结果刊登在近期的《生物信息学》（Bioinformatics）杂志上。

成对测序技术是一种复杂的昂贵的技术，可用来检测整个基因的改变。研究人员比较两种普通的测序校准程序，BIMA 在所有的项目测试中胜过 Burrows-Wheeler 校准仪和 Novoalign，在速度和可靠性检测中，BIMA V3 校准了对照组的基因组序列，比竞争者快 20 倍，准确度高 25%。而 BIMA 允许评价肿瘤基因组，只花费一小部分的时间，且仅需要几种普通的技术。

较早的 BIMA 版本已促进研究人员开发 T 细胞淋巴瘤，前列腺癌和子宫内膜癌。最新的版本建立在较早版本上，提高了速度和可靠性。

研究人员相信这个工具将能让人们更好地理解肿瘤基因组，更快地研究更多肿瘤样本，开发不同疾病的新型生物标志物，最终更好地治疗肿瘤患者。

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