科学家们在1月21日的《科学》(Science)杂志上,发表了以人类蛋白质图集(Human Protein Atlas)为基础的首个重量级分析结果。这项研究可以帮助人们进一步理解癌症相关蛋白、血液中流通的蛋白以及市面上现有药物的作用靶标。
人类蛋白质图集HPA是一个大型的跨国研究项目,去年十一月份这个团队根据一千三百万已注释的蛋白图像,发布了基于组织的人类蛋白互作图谱。这个开源数据库揭示了蛋白质在人体主要组织和器官中的分布,为人们展示了局限在特定组织(比如大脑、心脏或肝脏)的蛋白,以及出现在所有组织里的蛋白。HPA团队希望,这个开发性资源能够推动诊断试剂和治疗药物的开发,为科学家们提供人体的基础生物学线索。
发表在Science上的这项新研究,结合了基因组、转录组、蛋白质组和抗体分析数据,对人类大约两万个蛋白编码基因进行了分析和分类。领导这项研究的是瑞典皇家理工学院的Mathias Uhlén教授,他也是HPA项目的领导者。
研究人员发现,近一半的人类蛋白编码基因是普遍表达的,其蛋白出现在所有组织中。大约15%的基因在一种或几种组织或器官中集中表达,包括那些广为人知的组织特异性蛋白,比如胰岛素和肌钙蛋白。在各人体组织中,睾丸的蛋白集中表达现象最为显著,其次是大脑和肝脏。
进一步研究表明,细胞分泌的蛋白大约有三千种,另外还有5,500种蛋白定位在细胞的膜系统上。
“这对于制药企业来说是很重要的信息。研究显示,在现有药物的靶标中,70%是分泌蛋白或者膜结合蛋白,”Uhlén说。“值得注意的是,这些中的30%属于普遍性表达,存在于所有组织和器官中。这就是一些药物产生副作用的原因,相信药物开发者们能从中获得一定的启示。”
研究人员还分析了在机体不同部位发生的代谢反应。他们发现,特化程度最高的器官是肝脏,肝脏拥有大量自己独有的化学反应。
原文检索:
Tissue-based Atlas of the Human Proteome
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