让RNA病毒无法肆虐，韩科学家建立PCR引物数据库

上海高创化学科技有限公司

2017/01/04 09:10

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韩国大邱庆北科学技术学院（DGIST）的研究人员建立了一个全面的遗传信息公共数据库（MTPrimerV），可用于RNA病毒的检测和鉴定。在面对未来的公共卫生事件时，这个数据库将是很有价值的工具。

RNA病毒可能引起许多传染性的疾病，包括流行性感冒、脊髓灰质炎和麻疹。近年来，许多新的致命疾病都由RNA病毒引起，最为人所熟知的是急性呼吸综合征（SARS）和中东呼吸综合征（MERS），两者都造成严重的健康和经济影响。

2002年，中国南部爆发了严重的SARS疫情。最终，SARS病毒造成37个国家的774人死亡。去年，MERS病毒在韩国肆虐，造成旅游业收入锐减40%，对国民经济造成不利影响。

在这两种情况下，疾病的快速传播是由于病毒无法得到快速可靠的诊断。在疫情爆发时，准确的病原体检测和鉴定是必须的，有助于了解和控制疾病，从而尽量减少它对公共卫生的影响。

因成本低、灵敏度和特异性高，PCR技术被广泛用于病毒鉴定。在PCR鉴定中，引物设计是相当重要的一环。然而，现在只有极少的在线数据库提供了RNA病毒的高质量引物，而且对应用方面也有某些限制。

为了满足这种需求，大邱庆北科学技术学院的Min-Soo Kim和JaeHyung Koo建立了一个全面的PCR引物数据库，以便更快速、更高效地检测和鉴定RNA病毒。他们在《Nucleic Acids Research》上介绍了这一成果。

这个名为MTPrimerV的数据库包含了152,380,247对PCR引物，可检测1818种病毒，覆盖7144个基因编码序列或CDS，这些序列是编码蛋白质的DNA或RNA中的一部分。

据介绍，这些引物能够检测NCBI RefSeq数据库中包含的100%的RNA病毒。此外，MTPrimerV中的每对引物都经过了人和病毒序列的严格相似性检验，确保引物是高度特异性的。同时，MTPrimerV对最佳引物进行排序，这样用户在单重PCR时只需挑选第一对引物，在双重PCR时挑选前两对引物即可。

“我们相信，MRPrimerV的开放将促进病毒的宏基因组学研究，了解病毒的变异等等，并促进人们在未来更高效地应对流行病，”研究人员总结道。

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