新抗原肽合成和纯化一体化解决方案

在多肽相关研究中,通过固相多肽合成(SPPS)和多肽纯化的方法,我们可以获得高质量的多肽。但是,在实际应用中,特别是在癌症免疫治疗方面,我们通常需要快速获得一批新抗原肽,以缩短药物生产周期,而传统方法耗时长效率低。因此,在保证获得高质量新抗原肽的同时,进一步缩短获得新抗原肽的时间,成为多肽研究新的挑战和目标。

传统研究方法中多肽合成和纯化两个流程是分开进行的。对于需要一次获得大量的新抗原肽而言,传统固相多肽合成(SPPS)方法批量合成多肽的过程耗时较长,而且,传统的多肽纯化方法——高效液相色谱法(HPLC),单次只能纯化一个多肽,批量多肽的纯化需要依次进行,并且大多数新抗原肽是中长肽或疏水性强的复杂多肽,这对HPLC而言是一大挑战。所以,传统多肽研究方法获得大量新抗原肽的总体效率和质量都不高。

本文提出一种肿瘤新抗原肽合成和纯化一体化解决方案,1该方案在同一台仪器上将多肽合成和纯化的过程结合,利用一种全新的多肽纯化方法,实现高通量复杂多肽的平行纯化。这种一体化解决方案,一方面可以极大缩短批量获得新抗原肽的时间,不到24小时即可获得6个纯化后的多肽,另一方面还极大提高复杂肽纯化的纯度和质量,单次纯化平均纯度高达84%。

PurePep解决方案关键点

1 感应加热合成多肽

本研究选择了17个不同疏水性和长度的新抗原肽(P01-P17),包括6个已有文献记载的合成和纯化都具有很大挑战性的困难多肽(P12-P17)。2,3合成(0.1mmol)步骤如下:

  • 偶联:加入DIC/Oxyama,90℃条件下反应3分钟;

  • 封端:加入Ac2O/Pyr,50℃条件下反应2分钟;

  • Fmoc-脱保护:加入DMF/Pip,90℃条件下反应1分钟。

表 1 本研究中使用的新抗原肽序列。*指在室温下进行的合成

2 自动PEC多肽纯化

  • PEC-Linker在同时加入Oxyma/DMF条件下,60℃反应15分钟;

  • TFA切割常温下进行2小时(83:5:5:5:2 TFA/H2O/PhSH/EDT/TIS);

  • PEC纯化常温下进行5.2小时(通用性方法)。
     

表 2 所有新抗原肽合成后产量和纯度以及使用PEC纯化后产量和纯度(UV280)

3 利用HPLC进行精纯

  • Knauer Semi-prep. HPLC,15×2 cm C18柱;

  • 2ml Loop进样环,10-60%MeCN 30分钟。

 

表 3 P12-P17肽在使用感应加热-SPPS(IH)、IH+PEC、IH+HPLC和IH+PEC+HPLC后获得的纯度(UV280)。绿色表示IH-SPPS+HPLC具有更高的纯度。3

PurePep解决方案优势

1 PurePep Chorus快速合成多肽

  • PurePep Chorus(图1)结合感应加热进行多肽合成(IH-SPPS),并且支持同一台仪器上进行多肽切割和纯化;

  • 利用感应加热每个合成循环17分钟(图2),每组5-6个肽的合成总时间为2.5-7.4小时(包括封端);

  • 感应加热可合成常温合成失败的多肽(表3)。


图 1 PurePep Chorus全自动多肽合成仪

图 2 反应器感应加热

2 PurePep Chorus自动纯化多肽

  • 使用PEC自动试剂盒(图4)进行PEC正交纯化,获得PEC级肽,平均纯度达到84%,高于HPLC(表2);

  • PEC纯化法(图6)允许使用DMSO或HFIP溶剂,从而可以进行从SPPS到纯化的可靠处理;

  • 在5.2小时内自动纯化6个多肽,纯化后的多肽仪器可自动收集(图5),全过程实际手动操作的时间仅为36分钟;

  • PEC纯化后结合HPLC进行精纯(表3),平均纯度大于90%,包括报道的低合成效率低纯化效率序列。


图 4 PEC自动纯化试剂盒套件

图 5 加载琼脂糖的45 mL反应器,左侧的收集瓶可收集纯化的多肽

PurePep EasyClean(PEC)详细流程


图 6 PEC多肽纯化化学反应步骤,利用通用PEC-连接子系统连接目标肽以及“Catch & Release"技术无痕安全释放目标肽。

参考文献

1. R. Zitterbart et al. Chem Sci 2021, 12, 2389

2. N Hilf et al. Nature 2019, 565, 240

3. N. L. Truex, B. Pentelute et al. Sci Rep 2020, 10, 723


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