从琼脂糖中凝胶中回收DNA片段的技术

2016-06-30 07:33  下载量:1

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掌握从琼脂糖凝胶中回收DNA片段的技术。 DNA片段的胶回收: 电泳洗脱法 低熔点琼脂糖凝胶电泳挖块法 冻融回收法 玻璃奶回收法 柱回收法(按说明书进行) 胶回收注意事项: 将电泳槽用ddH2O反复清洗干净,倒入新鲜配制的灭菌电泳缓冲液; 根据点样量制备合适厚度的琼脂糖凝胶板; 切胶时尽可能切掉不含DNA片段的凝胶; 要尽量减少DNA在紫外下的照射时间以减少对DNA的损伤; 熔胶要完全。 目的基因片段与载体连接 实验目的:掌握DNA片段的体外连接技术。 DNA连接酶: 能催化双链DNA片段紧靠在一起的5’-P末端和3’-OH末端之间形成磷酸二酯键,使两末端连接。 E.coli DNA连接酶 T4 DNA连接酶 1、E.coli DNA连接酶: 由E.coli基因lig编码,需烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+)作为辅助因子。 修复双链DNA上的单链缺刻(nick),用于连接匹配粘端。 2、T4 DNA连接酶: 从T4噬菌体感染的E.coli中分离得到,由T4基因DNA30编码,需ATP作为辅助因子。 修复双链DNA上的单链缺刻(nick),用于连接匹配粘端; 连接RNA-DNA杂交双链上DNA链缺刻; 连接平端双链DNA分子。 1、修复双链DNA上的单链缺刻,用于连接匹配粘端。 带匹配粘端的DNA分子靠近时,自发形成暂时的碱基配对,利于连接酶把紧邻的5’-P与3’-OH连接到一起。 不同DNA片断通过匹配粘端的连接。 同一DNA片断通过匹配粘端的连接--自身环化。 2、连接RNA-DNA杂交双链中DNA链上的缺刻。 3、连接带平端的双链DNA分子。 注意: DNA连接酶不能催化两单链DNA分子连接; 只能连接双链DNA分子的单链缺刻(nick); 不能连接双链中1个或多个核苷酸缺失所致的缺口(gap)。 E.coli DNA连接酶:连接匹配粘端; T4 DNA连接酶:连接匹配粘端、平端。 最常用的为T4 DNA连接酶。 匹配粘端的连接: 1)哪些情况下会产生匹配粘端?

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