2023年6月1日,PacBio在上海交通大学Bio-X研究院举办了“PacBio HiFi测序全国巡演活动——上海场”。
PacBio专业的技术团队及交大该领域的专家学者,为大家奉献了精彩的学术报告,主要内容包括PacBio HiFi测序技术更新,PacBio HiFi测序应用最新进展,以及HiFi测序技术如何提供准确和可行的全基因组解决方案。
会议精彩缩影:
1.上海交通大学Bio-X研究院院长师咏勇教授欢迎致辞
2.PacBio技术人员介绍PacBio长片段测序特点
3.PacBio技术人员介绍Revio自动化测序平台
PacBio公司在会议上隆重介绍了近期推出的Revio自动化测序平台。Revio平台作为最新一代的高通量长读长测序系统,采用了25M SMRTcell,每次可以并行检测4张芯片,提供每年以30X覆盖率、多达1300个人类全基因组进行测序的能力。上海交通大学Bio-X研究院引入全国首台高校级PacBio Revio测序平台,为科研人员提供了先进的基因组测序工具,助力生命科学研究,进一步凸显Bio-X研究院生命科学研究实力。
Revio平台采用了PacBio独有的HiFi 测序技术,这种测序方法克服了传统测序技术的局限性,可同时实现长读长和高准确度的测序。因此,该平台可实现解析复杂的基因组区域、检测结构变异、揭示罕见变异和研究表观遗传学等,在各个领域的应用前景也非常广阔。长读长使其能够有效解析复杂的基因组结构,包括短读测序技术难以实现的高度重复的基因区域和基因组结构变异。高准确性也使得它能够发现短读测序技术可能错过的罕见变异,为精准医疗等提供更精确的基因变异信息。
为了确保HiFi测序能够实现长读长和高准确性,其测序文库需要去除小片段(<10kb),将文库大小限制在15-18kb范围内。该精准的文库要求,可确保测序数据的高质量,也印证了片段筛选是PacBio HiFi测序的关键步骤。然而在片段筛选环节,常规的磁珠筛选法无法去除干净小片段,也无法精准控制回收范围,大大影响了测序的数据质量和产量。美国Sage Science公司的脉冲场电泳全自动DNA片段回收仪,可满足上述需求,已成为HiFi文库构建的金标准和建库必备工具。
美国Sage Science公司拥有行业领先的DNA片段回收技术,其研发制造的Pippin系列全自动核酸电泳片段回收仪,采用了脉冲场电泳原理,可精准回收常规直流电泳无法有效分离的大分子DNA。此外,Sage Science公司拥有多项DNA片段回收相关美国技术专利,其Pippin系列产品可高效完成不同长度范围的DNA片段的精准回收,广泛用于二代测序、三代测序的文库构建以及多种分子生物学相关领域。此外,Sage Science最近推出了新的筛选模式“Range+T”,结合相应的预制胶试剂盒,进一步提高了9-30kb范围内片段筛选的分辨率,从而助力PacBio HiFi 测序获取质量更高的测序数据。
图示:“Range+T”模式回收的精确性
回收起点设置为15kb,设置不同回收时间,结果显示所有泳道回收起点一致,不同回收时间得到不同长度范围的文库
环亚生物科技有限公司作为美国Sage Science公司在中国区的独家代理商,自2011年以来将Sage Science的产品线引入国内,一直为国内用户提供专业的全自动核酸片段回收系统的安装测试、应用培训,技术支持与售后维护工作,赢得客户的一致好评与信任。来自Sage Science的Blue Pippin 全自动DNA脉冲场电泳回收仪,通过对大片段核酸的精准回收,助力PacBio HiFi测序开创三代测序新纪元。
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