菌落总数和致病菌有本质区别，菌落总数包括致病菌和有益菌，对人体有损害的主要是其中的致病菌，这些病菌会破坏肠道里正常的菌落环境，一部分可能在肠道被杀灭，一部分会留在身体里引起腹泻、损伤肝脏等身体器官，而有益菌包括酸奶中常被提起的乳酸菌等。但菌落总数超标也意味着致病菌超标的机会增大，增加危害人体健康的几率。
菌落总数超标说明该产品的卫生可能有问题。据悉，菌落总数测定是用来判定食品被细菌污染的程度及卫生质量，如果菌落总数超标严重，将会破坏食品的营养成分，加速食品的*败变质。消费者食用微生物超标严重的食品，很容易患痢疾等肠道疾病，可能引起呕吐、腹泻等症状，危害人体健康安全。
深圳市芬析仪器制造有限公司基于萤火虫发光原理，利用“荧光素酶—荧光素体系”研制而成；由于所有生物活细胞中含有恒量的ATP，所以ATP含量可以清晰地表明样品中微生物与其他生物残余的多少，深芬仪器ATP荧光检测仪适用于食品、饮用水中微生物快速检测，餐具洁净度快速检测，食品加工器具、工作台面、餐饮器具等消毒结果快速检测，医疗环境工作平台即时评估。该设备采用生物化学反应方法检测ATP菌落总数含量。
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