昨日,Paul S.Mischel教授团队在Nature杂志上发表了名为Circular ecDNA promotes accessible chromatin and high oncogene expression的文章,该文章首次解析了ecDNA的结构与功能。
那么什么是ecDNA呢?
研究团队发现,其实大量的癌基因并不在染色体上,而是会从染色体上脱落下来,变成一种小型的DNA,称为染色体外DNA(extrachromosomal DNA,简称ecDNA)
这种颠覆传统认知的发现到底意味着什么呢?文章指出ecDNA在肿瘤中普遍存在,同时由于缺乏着丝粒,导致其不遵照孟德尔定律进行遗传,是驱动肿瘤异质性的重要因素,也是导致肿瘤耐药性的诱因。这将对肿瘤的治疗带来极大的挑战。
我们知道,由于肿瘤存在异质性,所以传统的组织活检已经不能全面的解析肿瘤的真面目了。随着技术的发展,液体活检这一检测方法逐渐成为检测癌症的新手段。液体活检是指取患者的体液(血液、尿液、脑脊液等),通过测序或者数字PCR等方法对其中的肿瘤标志物进行检测,从而确定患者是否罹患疾病。
目前,在液体活检方面做得较为出色的平台要数来自法国stilla technologies公司的Naica全自动微滴芯片式数字PCR系统了。
该系统是法国stilla公司开发的下一代核酸绝对定量技术。使用cutting-edge微流体创新型芯片——Sapphire芯片作为数字PCR过程的唯一耗材。样品通过毛细通道网格以30,000个微滴的形式进入2D芯片中,可称作Crystal微滴。PCR扩增实验在芯片上实现。对微滴成像用以检测包含扩增片段的微滴。最后一步是对阳性微滴计数从而得到精准的核酸绝对数量。
该平台拥有强大的图像分析技术和直观可视的检测功能,从而达到了数字PCR定量卓越的置信水平,获得的数据真实可信。并且该系统目前为市面上最简单的数字PCR系统,可以实现3荧光通道检测的数字PCR平台,快速建立多重实验。
此外我们还为大家提供了Gene-π数字PCR学堂(www.cycloudbio.com数字PCR学堂快速入口),您可以选择感兴趣的应用教程,其中包含从实验设计到数据分析的详细工作流程。 您还可以通过搜索导航工具直接搜索特定的项目("dPCR的DNA准备","荧光溢出"等),或点击我们的"HOW TO" 选择您需要的部分(设计、分析、报告)。
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