专用于生物工程、生物医学以及制药工业的冻干机称为医药冻干机。这种医药冻干机能为生物医药的研发和工业生产提供必要的冻干工艺条件。医药冻干机的主要优点有：
①在较低温度下冻干，能够保持药物成分和生物制品的生物活性，对于很多热敏性药物生产尤为适用。
②在药物中的一些挥发性成分损失很少。又能在生产过程中免受微生物和酶类的污染，能较好的保持药物原来性状。
③冻干后药物与生物制品的体积变化很少，有利于保持其原有的结构。
④制品疏松多孔，呈海绵状，复水性好，加水后能够迅速而且完全地溶解，有利于药物吸收。
⑤冻干在真空条件下进行，一些易氧化的物质得到了保护。用医药冻干机冻干比其他干燥方法能够除去更多物质中的水分，稳定保存性更好。
⑥液体加工方便，简化了无菌作业过程，制品适合注射用针剂。
现今医药冻干机在生物制药行业得到了广泛的应用。
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