值此上元佳节,锐讯生物祝大家节日快乐,工作顺利,生活美满!
这次给大家带来锐讯DropX-1000数字PCR系统的介绍。
DropX-1000系列由三部分组成:
I. 全自动样本制备系统DMX-1000
II. 平板式快速扩增仪TC-1000
III. 生物芯片分析仪DScanner-1000
全自动样本制备系统DMX-1000
全自动样本制备系统DMX-1000配备气流发生装置和气压控制装置,能够实现高精度压力控制,结合专利产品液滴生成芯片和微流控乳液滴生成技术,DMX-1000可以在70秒内快速、稳定、高效地生成大小均一的微乳液滴。微滴数量可达2万-60万个,粒径范围30-120μm,性能稳定。除此之外,锐讯还提供微流控芯片的定制服务,以满足不同的液滴数目和尺寸要求。
图1:全自动样本制备系统DMX-1000
平板式快速扩增仪TC-1000
平板式快速扩增仪TC-1000,不再使用传统的96孔板,而是特制的液滴扩增芯片;不再是传统的“烧开水”加热模式,代之以平板式单液滴层均匀受热的方式。在这样的改进之下,TC-1000完成40个PCR循环只需约45分钟(TC-2.0升级版更是把时间缩短到了25分钟!),大幅缩短了等待时间,提升了实验进度。这对实验人员而言无疑是莫大的福利——在这么美好的日子里,一个孤独的身影在幽暗的实验室里加班̷̷光想一想整个人就不好了呢!
图2:平板式快速扩增仪TC-1000
生物芯片分析仪DScanner-1000
生物芯片分析仪DScanner-1000,分为双色(DS2-1000)和四色(DS4-1000)两种型号。双色荧光通道可检测FAM和HEX(VIC)色谱,四色则可检测FAM、HEX(VIC)、ROX、CY5等5种荧光。在同类产品中,四色荧光通道的设计是目前独一份儿的——这种领跑业界的设计极大地丰富了多重PCR的研究设计:双色荧光数字PCR仪可完成多至10重PCR(RainDance),而四色可以实现30重甚至更多的PCR设计。这在对样本进行大规模多位点(Multiplex)选择性筛查中,优势非常明显。
图3:生物芯片分析仪DScanner-1000
那么,DropX-1000数字PCR系统性能到底如何呢?
接下来给大家分享一下近期的测试对比案例。
G教授提供了4个质粒样本S1-S4,使用QPCR检出的L858R突变频率如下表。根据他的要求,我们采用这些样本在数字PCR平台上进行验证。为了对验证的结果更有把握,实验中加入一个标准品(STD)作为参照;另外,同时在国外金标准的数字PCR平台进行平行实验。
S1 | S2 | S3 | S4 | STD |
0.05% | 0.5% | 1% | 5% | 5% |
表1:L858R阳性样本(QPCR)及标准品(测序)
测试结果
国外金标准 锐讯
S1
S2
S3
S4
STD
突变频率:
QPCR | Golden Standard | Rainsure | |
S1 | 0.05% | 0.097% | 0.116% |
S2 | 0.5% | 0.923% | 0.938% |
S3 | 1% | 1.932% | 1.918% |
S4 | 5% | 9.114% | 9.263% |
Sequencing | Golden Standard | Rainsure | |
STD | 5% | 5.471% | 6.172% |
表2:数字PCR结果与QPCR的比较
表3:锐讯与国外金标准的结果一致性曲线
结果分析
1. QPCR的定量结果并不准确,精确度不及数字PCR;
2. Rainsure数字PCR检测结果与国外数字PCR金标准的数据相当接近,整体上一致性非常高(R2>0.99)。
G教授对我们的测试结果非常满意,认为我们总体上达到甚至超越了国外金标准的水平。
非常感谢教授的溢美之词,我们依旧将砥砺前行,踏踏实实做好技术研发的每一步,以质(Quality)取胜。
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