2020旧历庚子年春节,将注定被铭刻在人类抗疫的史册上。占全球人口五分之一的中国迎来自己一年一度最盛大的节日——春节。数亿人将返乡、数亿人将外出旅行,他们的足迹将遍及祖国大江南北每个乡村和世界各大名胜秀地。然而新型冠状病毒的阴影在佳节前开始蔓延,并因春节到来防控难度被指数级放大。新冠病毒的防控从一开始就受到了我国政府及世卫组织的高度重视。
1月20日,中共中央总书记、国家主席、中央军委主席习近平作出重要指示,强调要把人民群众生命安全和身体健康放在第一位,坚决遏制疫情蔓延势头。
面对疫情,华大积极参与病原研究,第一时间予以技术支持,并携手多国及地区开展病原合作,进行病毒快速检测、鉴定及病毒变异监测。在最早一批提交至全球共享流感病毒数据库GISAID发布的13例新型冠状病毒基因组序列数据中,有5例数据来自华大智造高通量测序仪——MGISEQ-2000,这为研究分析武汉新型冠状病毒的进化来源、致病病理机制提供了第一手资料。
一、研发先行,资质开路,华大为抗击疫情提供完整检测解决方案
2020年1月初,华大基因下属子公司紧急组织科研及生产力量,开始了相关试剂盒的研制工作。在通过严格的试剂盒生产工艺和质量控制等环节确保稳定性和准确性后,于1月14日官方宣布完成2019新型冠状病毒核酸检测试剂盒(RT-PCR荧光探针法)成品的全部研制工作。该新型冠状病毒核酸检测试剂盒可以用于疑似患者的快速识别、鉴定,协助疾控部门和医疗机构采取及时有效的防控措施。
在此期间MGISEQ-2000再次发挥了其全面灵活、质量稳定、测序速度快等优势。基于MGISEQ-2000高通量测序仪进行高敏PMseq-RNA检测,对于部分病毒含量较低的样本,可以作为核酸检测试剂盒(RT-PCR荧光探针法)的补充,能够提高阳性检出率,避免漏检;对于疑似感染、多重感染或继发感染病原样本,可以提供更多可能感染的病原信息,确定病原的完整基因组,来源和变异情况,提供致病病理机制有效依据,辅助临床更加有效的诊疗。
目前华大基因已在提供新型冠状病毒第三方检测服务。以华大集团旗下华大智造生产的系列测序仪为核心构成的世界领先高通量测序平台,坚如磐石的支撑着大疫当前病毒检测的质量与数量需求。
华大基因新型冠状病毒检测试剂盒和华大智造DNBSEQ-T7测序系统获得国药监局应急审批
冠状病毒以其不稳定、高变异性著称,因此在用RT-PCR试剂盒筛查的同时,也需用超级测序仪对病毒进行可能的变异监控。
此次华大基因有两款试剂盒通过国药监局应急审批。其中新型冠状病毒2019-nCoV核酸检测试剂盒(荧光PCR法),基于RT-PCR技术可实现3个小时内快速检测;另一款新型冠状病毒2019-nCoV核酸检测试剂盒(联合探针锚定聚合测序法)则是基于宏基因组测序的检测试剂盒,能够鉴别诊断包括新冠状病毒在内的其他冠状病毒和呼吸道病原的感染,实现病毒序列快速检测。获批试剂盒将会发往各地医院、疾控中心和出入境检验检疫局,用于测定疑似患者的样本中是否有新型冠状病毒。
和两款试剂盒及分析软件一同获批的DNBSEQ-T7测序系统,是目前全世界日通量最高的测序仪,它能在5小时内完成SE50测序,每次运行样本检测通量达到50-200样本,每个样本可获得平均100 M以上数据产出;最快可在20小时内对128个病例实现从样本到下机报告的输出,且每个样本经高通量测序获得的总Reads数超过100 M reads,能有效提高病原微生物的检测灵敏度,在确保高准确度检测外,能提供进一步病毒演变分析数据支持。
为此,华大基因紧急运送2台华大智造超高通量测序仪DNBSEQ-T7支援武汉。作为超高通量测序仪,T7搭载自动化样本制备系统,有望解决检测瓶颈,进一步提升送检样本的检测效率,对武汉疫情的科学临床防控提供强有力的技术支撑。
精准的qRT-PCR检测,配合必要的基因测序复核,为抗击疫情提供新型冠状病毒检测整体解决方案
截止目前,华大已探索出针对新型冠状病毒检测行之有效的整体解决方案:精准的qRT-PCR检测,配合必要的基因测序复核及抗体水平的评估是“纾临床诊断之困,解社会恐慌之压、破武汉封城之局”的最佳组合。
使用快速检测试剂盒(新型冠状病毒2019-nCoV核酸检测试剂盒—荧光PCR法)3个小时左右快速检测出具报告。针对阴性疑似样本使用基于宏基因组测序的新型冠状病毒2019-nCoV核酸检测试剂盒(联合探针锚定聚合测序法)进行补充复核,同时鉴别诊断包括新冠状病毒在内的其他冠状病毒和呼吸道病原的感染。使用抗体检测可以了解人群中有多少人曾经感染过新冠病毒,筛查出无症状感染者。
因此结合RT-PCR和宏基因组检测,可更快、更全面覆盖2019-nCoV病毒检测,并监测新型冠状病毒在传播过程中可能会发生的变异,进一步结合抗体检测进行流行病学调查。这对新冠的彻底防控以及类似病毒流行病学的研究与防控,具有重要意义。
二、主动出击,极致交付,捐赠驰援送爱心
疫情攻坚,需要多方力量共同努力,目前华大主动出击和各地疾控中心紧密合作,依托高通量测序系统MGISEQ-2000和T7,快速对各地疑似患者进行宏基因组测序分析,凭借数据质量准确稳定和通量灵活等特点,在多地为新冠状病毒疫情的科学临床防控提供有力的平台支撑。在疫情发生期间,物流运输和技术支持不间断提供服务,确保各地检测第一时间顺利开展,在最短时间产出高质量的测序数据。战胜疫情,共克时艰。
全力保障试剂盒生产和供应,极致交付,为疫情一线提供最快响应
春节期间,华大已快速成立了应急指挥部,安排人员专职负责生产、质量、储运方面的监控和应急值守,开足马力、全力以赴保障检测试剂盒的生产和供应,以尽快让武汉及全国的疑似病例都能在第一时间使用试剂盒,并在到样后3小时左右出检测结果,有效防控疫情蔓延。华大武汉、深圳、天津等各地团队均已随时待命,为疫情一线防控提供最快响应。
据悉,华大目前已向包括武汉地区在内的全国各地共投放试剂盒约5万人份。
同时,华大分别宣布向武汉、湖北各捐赠1万人份新型冠状病毒检测试剂盒,以驰援当地新冠肺炎防控。眼见疫情防控形势严峻,又于1月29日宣布联合各界爱心机构和人士追加捐赠10万份新型冠状病毒检测试剂盒。
在全力满足国内检测需求的同时,面向国际华大还与文莱卫生部、泰国公共卫生部、尼日利亚国家医学研究中心(NIMR)、南非国家卫生实验局国家传染病研究所(NICD)、中国香港和台湾地区的相关机构,达成“新型冠状病毒试剂盒”的供应和其他病原监测方面的合作。
三、服务升级,想一线之所想,急抗疫之所急
疫情前线临床普遍反应,目前各地满足筛查条件和筛查能力的检测实验室数量有限,已有的实验室满负荷工作,无法满足短时间内对所有疑似病患进行病毒筛查与确诊。然而病毒筛查是此次防控疫情的核心,早一分钟确诊,病患就能早一步得到精准的治疗,就能更早康复。这既是高瞻远瞩的国家战略需要,也是普惠健康的民生工程,更是疫情当前急需解决的实际问题。
华大集团、万科集团、松禾资本30日对外宣布,将以湖北省为重点地区,在全国范围内紧急征集大约20家PCR医学实验室,通过猛犸基金会对于具备一定条件的医学实验室,提供资金和专业支持,使其快速提升检测能力,以应对不断增加的检测需求,预计捐赠投入近千万元。
同时,针对抗疫一线检验人员对病原微生物检测临床应用实验室操作的培训需求,华大已调集专家紧急制作培训视频,免费上线面向公众开放。
华大已做好充分准备,将一如既往利用基因科技的力量,助力国家疫情防控,维护全球卫生安全。疫情攻坚,需要多方力量共同努力,愿更多有志之士携手共进,战胜疫情,共克时艰。
供稿:华大基因股份有限公司医疗器械部
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