全光谱流式高参数数据如何保证高质量?--- 颜色数量与数据质量的平衡艺术(内附视频链接)

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Cytek®全光谱流式技术及产品自发布以来,因其超多色的检测能力和卓越的灵敏度等特性,深受广大流式用户的肯定与支持,并逐步掀起了业内各厂家布局全光谱流式赛道的热潮。随着全光谱流式的逐渐普及,越来越多的用户开启了高参数流式之旅,而产出高质量的多色流式数据,也变成了更为广泛的需求……如果说追求颜色数量与数据质量的平衡是一场精彩的艺术演绎,那么,拥有一台值得信赖的全光谱流式细胞仪只是开始,强大的技术服务与支持将是最佳助力



来自Cytek公司的首席科学家Maria C. Jaimes,是非常严谨的流式技术专家,对流式数据的质量有着很高的追求,

她也是Cytek两篇里程碑级文章(40色45色)的作者之一,拥有丰富的全光谱流式多色方案设计与优化实战经验,

可以说是当下最具经验的全光谱流式技术专家之一。前不久,Maria在线上给大家分享了有关全光谱流式颜色数量和

数据质量的平衡艺术的专题讲座,接下来,让我们一起走进她的讲座,领略这场精彩的艺术平衡之旅。

高参数流式方案追求低的荧光溢漏扩散和高的数据分辨率,从而得以呈现高质量的数据结果。而这一目标的实现,是仪器光学系统的最优设计、检测器性能、仪器设置、方案设计和优化等诸多因素相辅相成的结果。


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作为实验人员,如何搭建高质量的多参数方案呢?OMIP-069就是值得参考的指南性的文章,建议全光谱流式的使用人员阅读这篇文章的补充材料,详实的材料一步步地描述了方案设计和优化的思路和技巧。OMIP-069是Cytek研发与技术团队的经典佳作,也体现了Cytek在全光谱流式领域强大的技术力量


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当检测颜色不多时,例如只有2个颜色,实验普遍都能得到清晰分群的结果。当方案升级到40色甚至超过40色时,是否意味着此时就需要牺牲数据的分辨率呢?答案当然是否定的,而接下来分享的45色方案,生动地阐释了颜色数量和数据质量的平衡艺术。


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45色方案的设计起点基于40色经典方案,第一步考虑到部分试剂的可用性及数据表现的可优化性,对原方案的部分试剂进行了替换。第二步扩展方案,在人单个核细胞的基础上,重点聚焦于记忆T细胞的免疫表型进行深入剖析。横向对比两个方案的数据表现,45色方案获得了相当甚至于更优的分辨率


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45色方案设计借助Cytek® Cloud云端配色工具,一站式集成了全光谱流式方案设计到数据采集的在线工具,Panel Builder内置预先设计的多色方案和OMIP已发表方案,用户可以一键检索并以此为基础进行修改,也可以自主DIY设计方案;Experiment Builder将多色方案无缝传递至SpectroFlo®软件,简化了上机流程。


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全光谱流式捕获荧光素完整光谱特征,相较于传统流式,能够兼容发射光谱高度相似的荧光素。45色方案中作者测试了一系列相似的荧光组合对,均能被清晰地区分,FMO对照也进一步证明了相似染料并未对多色结果产生影响。


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聚焦于记忆T细胞,细分出众多细胞亚群,这个方案的亮点之一在于颜色多,但是对于低比例细胞亚群依旧保持卓越的分辨率,不同分化状态的记忆T细胞的功能性指标表达图谱均得到了“高清”呈现。


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Cytek® Aurora™ 分析系统和 Cytek® Aurora™ CS 分选系统搭载相同的全光谱分析(FSP™)技术,实验方案可在分析分选平台实现无缝衔接,两个系统的二维散点图和降维可视化分析结果均展现出45色深度免疫表型方案的高度可比性。


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进一步,在Cytek® Aurora™ CS 分选仪上,实现了一管样本6路同时分选低比例细胞,并对分选后的细胞进行胞内细胞因子检测,证明了经过分选的6群记忆T细胞亚群的功能性维持正常。


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综上,高质量数据应作为高维方案设计和优化的主要目标,Cytek® 40色和45色方案可以作为指南参考,Cytek® Cloud可以作为实验设计化繁为简的有利工具。Cytek® Aurora™分析系统和Cytek® Aurora™ CS分选系统无缝衔接,为流式高质量数据的呈现定义了新的金标准

在聆听这场讲座之前,也欢迎大家点击阅读:

高质量数据新标准,Cytek谱写45色全光谱流式方案二重奏(分析+分选)


请关注CytekBioscience微信视频号,点击查看合集Cytek流式讲座-The Balancing Act Between Number

Of Colors And Data Quality: Lessons Learned From Human Memory T Cells查看完整讲座视频。


或者访问原文章链接https://mp.weixin.qq.com/s/Ug15yH68mIObyAT7ZmYAeQ,以获取视频。

参考文献

1Park, L. M., Lannigan, J. & Jaimes, M. C. OMIP-069: Forty-Color Full Spectrum Flow Cytometry Panel for Deep Immunophenotyping of Major

 Cell Subsets in Human Peripheral Blood. Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology 97, 1044-1051, doi:10.1002/cyto.a.24213 (2020).

2Bonilla, D. L., Park, L., Low, Q., Lannigan, J. & Jaimes, M. J. b. 45-Color Full Spectrum Flow Cytometry Panel for Deep Immunophenotyping of the Major Lineages Present in Human Peripheral Blood Mononuclear Cells with Emphasis on the T cell Memory Compartment. 2024.2004. 2027.591472 (2024).



关于Cytek

About Cytek /

Cytek Biosciences, Inc.(Nasdaq: CTKB)作为一家全球技术领先的生命科学技术公司,通过其受专利保护的全光谱分析(Full Spectrum Profiling™,FSP™)技术,提供高分辨率、高参数和高灵敏度的新一代细胞分析工具。Cytek的创新技术通过检测荧光信号的完整光谱信息,以实现更高水平更高灵敏度的多参数检测。Cytek的FSP™平台包括其核心仪器 ——Aurora和Northern Lights™分析系统、Aurora CS分选系统,Amnis®和Guava®品牌下的流式细胞仪和成像产品,Cytek Orion™全自动试剂预混系统,以及试剂、软件和服务,为客户提供全面和完整的解决方案。Cytek总部位于美国加利福尼亚州Fremont,在全球设有分部和分销渠道。更多的相关信息,请登录Cytek的官方网站:www.cytekbio.com和www.cytekbio.com.cn。

注:Cytek的产品仅供科研使用,不可用于临床诊断(Cytek® Northern Lights-CLC系统,DxP Athena®系统以及部分试剂除外)。

CytekTonbo Biosciences, cFluor, SpectroFlo, ESP, Full Spectrum Profiling, FSP, DxP Athena, Cytek Aurora, Northern Lights, Cytek Orion, Amnis, Guava 和 ImageStream 是Cytek Biosciences, Inc.的商标。

Cytek®全光谱检测技术相关专利包括但不限于:US10739245B2,US11169076B2,US10788411B2。

Guava®系列产品涉及的专利包括但不限于:US7320775B2,US7410809B2。





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