【知识分享】直接随机光学重建显微镜 (dSTORM) 在人肾小球疾病组织学分析中的应用

【知识分享】直接随机光学重建显微镜 (dSTORM) 在人肾小球疾病组织学分析中的应用

文献解读 知识分享

01

研究介绍(节选)


肾脏疾病的诊断非常复杂且具有挑战性,通常需要使用到光学显微镜(LM)、免疫组织学和电子显微镜(EM)。EM在~50%的天然肾活检的组织病理学中比较有用,对~20%的诊断也是十分重要,这使得EM在许多国家/地区成为天然肾活检检查的标准技术。EM常用于诊断与基底膜结构异常、原纤维疾病和罕见的遗传性疾病相关的肾脏疾病。它也经常用于记录足细胞的形态变化,并记录免疫复合物或补体片段沉积物的形状、亚结构和相对于肾小球基底膜 (GBM)的位置。


然而,目前世界上大部分人都无法使用上EM仪器,且在可使用的地方,相关的专家和设施的数量也正在减少。对于发展中国家和发达国家来说,找到一种更便宜的EM替代品,来增强诊断能力,超越LM和IF,减少所需的仪器数量、简化和加速诊断工作流程,是非常重要的。


近年,光学显微镜已经通过超分辨显微镜(SRM)技术突破了衍射极限,如结构化照明显微镜(SIM)、随机切换单分子定位显微镜(SMLM)技术、光激活定位显微镜和随机光学重建显微镜(STORM)等。


如直接随机光学重建显微镜(dSTORM)的技术所示.在之前一种作者称之为“easySTORM”的方法中,作者已经证明了dSTORM可以使用多模二极管激光器和多模光纤以相对较低的成本(<20,000 英镑)在大视场上(>120 × 120 μm)稳定提供超分辨图像。作者表明,这种方法可以应用于临床组织学切片,以使用临床批准的抗体提供超分辨率的IF成像。作者将其描述为“histoSTORM”方法。


作者特别探讨了在肾脏疾病诊断中,用histoSTORM取代EM的可能性,或许能提供一种仪器成本较低的、能够广泛使用的临床工具。这是在早期使用SIM 和STORM 研究GBM中的肾足细胞亚结构和蛋白质组织的工作之后进行的。虽然之前的工作证明了超分辨IF的潜力,但它是通过昂贵的商业SRM仪器实现的,并且利用STORM的研究是用小鼠组织和非临床批准的抗体进行的。


作者的目标是开发一种低成本的方法,让大部分国家地区的临床医生可以使用“easySTORM”对临床相关蛋白质进行成像,并且能使用现有的临床验证抗体制定实用方案来处理现有的活检样本,如冷冻切片或石蜡(FFPE)切片等。作者注意到STORM以前已被应用于病理学研究,例如研究表观遗传调节和癌症的进展等。


02

研究结果


在最初的小型研究中,作者将带有标准临床批准抗体的 histoSTORM 应用于 FFPE 和冷冻组织切片。作者相信下面呈现的示例性结果显示了可能有助于诊断的、具有临床意义的超微结构


膜性肾小球肾炎(图1)的特征是基底膜内膜含有IgG的上皮下免疫复合物沉积物,且该结构增厚。图1D中的双色宽视场IF图像显示了一个毛细管环,其中GBM为绿色,带有抗人层粘连蛋白探针(绿色,Alexa Fluor 555),过滤屏障上皮侧的IgG沉积物为红色(IgG,iFluor 647)。以每像素25nm显示的dSTORM图像显示了与EM观察到的图像一致的定义明确的上皮下沉积物(图1F,I)。虽然在宽视场IF图像中没有明确的结构定义(图1D,G),但在dSTORM中很容易观察到上皮下区域的免疫沉积物的细节和免疫沉积物含量的梯度(图1E,H)。dSTORM图像的绿色区域表示无免疫沉积物的GBM区域,黄色区域表示层粘连蛋白和免疫沉积物的重叠,红色区域表示免疫沉积物簇。

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图1、膜性肾小球肾炎。基底膜(层粘连蛋白,绿色 - Alexa Fluor 555)和IgG沉积物(红色 - iFluor 647)。


(A–C)膜性肾小球肾炎冷冻切片×100倍放大的宽视场IF图像显示。

(A)层粘连蛋白通道。

(B)IgG通道。

(C)在(A)和(B)中由黄色方块指示的区域的扩展双通道图像。

(D)由(C)中黄色正方形表示的区域的宽视场 IF。

(E) 像素大小为 25 nm 的相应 STORM 图像。

(F)在×5500倍放大率下从同一活检中获得类似结构的电子显微镜照片。

(G)在(D)和 (E)中指出的3.2 × 2.4 μm 的2区域宽视场 IF 图像。

(H)对应的 STORM 图像。

(I)在(F)所示区域的扩展电子显微镜图像。

黄色虚线表示浅灰色的 GBM。上皮下侧的深灰色电子致密沉积物(紫色箭头)代表含有IgG的免疫复合物。


狼疮性肾炎的特征是多克隆 IgG 在肾小球不同区域的肾小球沉积 。图2显示了Iv期狼疮肾炎肾小球毛细血管中IgG(红色,iFluor 647)的沉积和基底膜染色(层粘连蛋白,绿色,Alexa Fluor 555)。在此阶段,系膜(图2G),内皮下(图2H)和上皮下(图2I)IgG沉积物很容易用dSTORM观察到,并概括了用EM记录的高电子密度IgG沉积物的分布(图2C)。

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图2、狼疮性肾炎IV型。基底膜(层粘连蛋白,绿色 - Alexa Fluor 555)和IgG沉积物(红色 - iFluor 647)。


(A)冷冻切片×100放大倍率下的宽视场IF图像,显示IV型狼疮性肾炎,所选区域存在(D,G)系膜沉积物,(E,H)内皮下沉积物和(F,I)上皮下沉积物。

(B) 对应于(A),以像素大小为25 nm 显示的 STORM 图像。

(C)以×8000倍放大率从同一样品获得类似结构的电子显微照片,在GBM的上皮下侧(紫色箭头),在BBM的内皮下侧(蓝色箭头)和系膜(黄色星)中偶尔显示含有IgG的电子致密沉积物。

(G–I)对应于宽视场 IF 图像 (D–F) 的STORM图像。

(D)和(G)显示(A)和(B)中的黄色正方形所指示的区域。

(E)和(H)显示(A)和(B)中的青色方块所指示的区域。

(F)和 (I)显示(A)和(B)中的紫色正方形所指示的区域。

easySTORM提供了分辨率低于衍射极限的大视场(120μm×120μm)允许评估肾小球毛细血管中的GBM厚度并记录肾小球的其他方面。图3A、C显示了来自微小变化疾病活检的FFPE切片的宽视场落射荧光图像,其中GBM中的层粘连蛋白用iFluor 647标记。图3B、D显示了相应的STORM图像,并确认了STORM图像在衍射极限以下进行GBM厚度测量的能力。图3F、G显示了通过GBM的宽视场和STORM图像的线段。图3E显示了GBM宽度为281nm的电子显微镜照片。

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图3、微小变化病:GBM厚度测量(层粘连蛋白-iFluor 647)。

(A) FFPE 部分放大倍率为 ×100 倍的宽视场 IF 图像。

(B)(A)中所示区域的渲染风暴图像。

(C)(A)中黄色框中所示区域的宽视场插图。

(D)(B)中黄色框中所示区域的 STORM 插图,像素大小为 25 nm。

(E)从同一活检的不同部分以×15500倍放大倍率拍摄的GBM的电子显微镜照片,其指定位置的GBM厚度为281nm。

(F) 在黄线 (657 nm) 位置从宽场 IF 图像 (C) 测量的 GBM 厚度 (半高全宽)。 

(G) 风暴图像 (D) 在黄线 (212 nm) 位置的测量厚度 (半高全宽)。

03

超高分辨显微成像系统iSTORM


目前,在国内,随机光学重建显微镜STORM已成功实现商用,现已发布的超高分辨率显微成像系统 iSTORM,成功实现了光学显微镜对衍射极限的突破,使得在 20纳米的分辨率尺度上从事生物大分子的单分子定位与计数亚细胞及超分子结构解析生物大分子生物动力学等的研究成为现实,从而给生命科学、医学等领域带来重大突破

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超高分辨率显微成像系统 iSTORM 具有 20 纳米超高分辨率、3通道同时成像、3D同步拍摄、实时重构、2小时新手掌握等特点,并提供荧光染料选择、样本制备、成像服务与实验方案整体解决方案,以纳米级观测精度、高稳定性、广泛环境适用、快速成像、简易操作等优异特性,获得了超过50家科研小组和100多位科研人员的高度认可。


参考文献

Garcia E, Lightley J, Kumar S, Kalita R, Gőrlitz F, Alexandrov Y, Cook T, Dunsby C, Neil MA, Roufosse CA, French PM. Application of direct stochastic optical reconstruction microscopy (dSTORM) to the histological analysis of human glomerular disease. J Pathol Clin Res. 2021 Sep;7(5):438-445. doi: 10.1002/cjp2.217. Epub 2021 May 21. PMID: 34018698; PMCID: PMC8363924.




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