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【应用案例】超分辨率荧光成像揭示Trop2对非小细胞肺癌和正常细胞膜的变化
跨膜糖蛋白Trop2与许多上皮癌有关。它不仅在促进胎儿肺生长方面发挥作用,还参与肿瘤发生、恶性转化和肿瘤播散。然而,Trop2在分子水平上的详细分布仍然未知。本文使用直接随机光学重建显微镜揭示了Trop2在培养和原代肺癌细胞和正常细胞膜上的空间组织。所有类型的癌细胞都比正常细胞呈现更多的Trop2定位。通过SR-Teseller聚类分析,我们发现Trop2以簇的形式存在于所有膜上;然而,癌细胞产生的簇比正常细胞更多,由更多的分子组成。本研究结果揭示了膜Trop2的异质分布,突出了肺癌细胞与正常细胞之间膜Trop2聚集特征的显著差异,为进一步研究Trop2聚集在肺癌中的机制和功能奠定了基础。
研究结果(节选)
1.Trop2在不同培养细胞上的高分辨率成像
2.通过SR-Tesseler方法对Trop2进行聚类分析
除了获得Trop2的高分辨率图像外,使用合适的方法来定量分析蛋白质的空间分布同样重要。到目前为止,各种分析方法已被应用于超分辨率成像数据,例如Ripley's K函数,DBSCAN (基于密度的噪声空间聚类分析),H-SET [36](分层单发射器假设检验)和FOCAL (用于定位的快速优化聚类算法)。每种算法都有自己的优势和应用范围。在这里,我们使用了一种新的图形处理方法SR-Tesseler,它可以精确地分割定位并提取集群的信息。
图 2. SR-Tesseler分析示意图
3.Trop2 在原发性肺癌细胞上的显着簇分布
为了进一步探索和验证Trop2簇在原代细胞上的分布特征,我们选择人原发性肺腺癌细胞作为NSCLC的代表,配对原代正常肺上皮细胞作为对照。与培养细胞一致,dSTORM图像显示Trop2过度表达并在肺癌细胞上形成大簇,而在正常肺细胞上存在相对较少的蛋白质和小簇(图3a-f)。统计数据表明,Trop2在癌细胞上的定位密度几乎是正常细胞的两倍(图3g)。SR-Tesseler分析还证明了聚类特征的显著差异。癌细胞上的簇面积和簇数都远大于正常细胞上的簇面积和簇数(图3h-i)。此外,癌细胞具有更密集的簇,由200多个定位组成,而对于不超过100个定位的小簇,正常细胞占更大的比例(图3j)。结果与从A549和HBE细胞获得的结果一致。这些发现证实了Trop2与肺癌的肿瘤发生有关,其过表达和聚集分布可能使其成为肺癌诊断的良好标志物。
图 3.原发性肺腺癌细胞和正常细胞上的 Trop2 分布通过 dSTORM 成像显示
结论
综上所述,利用dSTORM观察了Trop2在NSCLC细胞和正常细胞(培养细胞和原代细胞)膜上的分布格局,并利用SR-Tesseler分析了其聚集特征。我们发现Trop2在癌细胞上的表达和聚集水平高于正常细胞,这表明Trop2在癌细胞中的过表达和聚集的共同特征,这将有助于早期癌症诊断。尽管Trop2簇存在于所有肺癌细胞中,但值得注意的是,不同种类的癌细胞之间的团簇性质不同。例如,A549和H460细胞具有相对更多的簇,而SK-MES-1细胞具有与HBE细胞相似的簇数。我们的研究结果为癌症相关蛋白(如Trop2)聚集的分子机制提供了新的见解,并有利于开发针对癌症中Trop2的新药。
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