ARTP 诱变钝顶螺旋藻突变体比较组学研究

本期为您推荐清华大学化学工程系生物化工研究所邢新会教授研究团队发表在《化工学报》上的一篇文章:ARTP 诱变钝顶螺旋藻突变体比较组学研究。

文章摘要内容如下:

微藻作为地球上重要的生物资源,为水圈提供了大量的初级代谢产物,是合成生物学和生物制造研究和应用的重要底盘微生物。其中,钝顶螺旋藻(Spirulina platensis)具有多糖含量高、营养价值高、培养工艺成熟、应用范围广等特点,其诱变育种及比较组学研究可为微藻细胞工厂系统改造技术发展提供重要依据。

本研究前期通过常压室温等离子体(Atmospheric and Room Temperature Plasmas, ARTP)诱变方法获得了三株钝顶螺旋藻突变体。在连续光照培养条件下,对三株突变体的重要生理特征进行了表征,发现突变株具有高絮凝表型,且重要化合物含量也与野生型具有一定的差异。进一步,本研究通过对其主要代谢产物的代谢组学分析和全基因组测序,对突变表型产生的机理进行了初步解析。结果表明,突变株的高絮凝表型很源于生长早期糖合成过程的强化。最后,通过全基因组测序和比较基因组学分析,得到三株突变体 3-A10、3-B2 和 4-B3基因组上 1591、1059 和 1823 个错译单碱基突变以及 82、56 和 81 个错译插入/缺失突变。初步的功能聚类分析表明,显著突变基因涉及的代谢途径多达 68 条,涉及嘌呤代谢、氨基酸生物合成、叶绿素代谢、光合作用/固碳、氮元素代谢途径、糖类合成/代谢等重多重要的生理过程。

 文章精彩内容如下:

 1 野生和三株突变藻株在连续光照培养条件下的生长曲线

 2 突变体藻株在生长过程中的絮凝度变化


 7 测定中间代谢产物在各代谢途径中的分布


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