内毒素反应敏感性也涉及Nramp 1（natural resistant associated macrophage protein-1）、主要组织相容复合体Ⅱ类分子（major histocompatibility complex Ⅱ ，MHCⅡ、G蛋白、K+通道、Ran-GTPase等因素。
Nramp 1为天然耐受相关巨噬细胞蛋白-1，该蛋白质突变可以降低细胞吞噬体的酸化作用，对分枝杆菌感染具有易患性，Nramp 1编码一个完整膜蛋白，在受感染的巨噬细胞中能够被募集到吞噬体的胞膜上。Hackam等运用微荧光比例成像技术进行显色，比较野生型Nramp 1和突变型Nramp 1小鼠的巨噬细胞特性，分析含有惰性颗粒和活体分枝杆菌的突变型Nramp 1巨噬细胞中的吞噬体的pH值。与突变型Nramp 1相比，含有牛分枝杆菌的野生型巨噬细胞吞噬体中的pH值更低。但不能用质子消耗，超氧化物的歧化作用、吞噬体的缓冲能力、反向离子转导，或质子“渗漏”的比例失调来解释酸化程度的不同。Nramp 1能影响细胞内分枝杆菌繁殖，主要是通过调节吞噬体 pH值高低进行的，其中Nramp 1起着关键性作用。
在LPS发生效应时，可能会涉及LPS内化。TLR2识别革兰阳性菌的脂蛋白后，被内化到吞噬体内，引发信号转导效应。至于TLR4是否同样也内化吞噬体内，尚无文献报道。吞噬体的不同pH值会影响配体-受体的相互作用。由于Nramp 1能够作用于吞噬体，产生显著酸化效应，并导致LPS构象的改变，故不同酸碱度能够影响LPS 的构象，例如LPS负电荷的多少影响巨噬细胞IL-6的分泌，因而产生不同的效应。当Nramp 1突变影响吞噬体的pH时，势必也影响LPS的构象，引起宿主不同的反应，以致出现内毒素反应低下的表现。
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