内毒素等可激活补体级联反应，补体激活则形成过敏毒素C3a、C5a，以及末端补体复合物。
过敏毒素可引起平滑肌痉挛收缩，增加血管通透性，促使细胞释放多种生物活性物质，如组胺、前列腺素（PG）、白细胞三烯（LT）、5-羟色胺、白细胞介素-6、溶酶体酶等，并促进白细胞黏附与聚集，促进白细胞与血管内皮的黏附、游离出血管及局部集中，并具有强力的趋化作用，其中尤以C5a作用最为强烈。多数研究表明，高浓度的过敏毒素与急性呼吸窘迫综合征（ARDS）或多器官功能衰竭有关。亦已发现补体固有成分C3和C4对内毒素休克有保护作用，末端补体复合物可溶破和消耗靶细胞，从而起到保护机体的作用。所以，内毒素可激活补体，并与补体激活后引起的脏器功能损害及衰竭有关，同时补体亦具有杀菌和保护内毒素休克的作用。
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