上热搜的“肺炎支原体”是啥？纳米孔测序一站式搞定快速检测！

成都齐碳科技有限公司

2023/10/23 13:33

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由病原微生物引起的感染性疾病是人类发病率和死亡率最高的疾病之一，由于病种繁多，临床表现复杂，已然成为全球严重的公共卫生问题之一。

随着秋冬季节到来，包括病毒感染、支原体感染、细菌感染等多种类型的呼吸道疾病患者明显增加，呼吸道迎来感染高发季。近来频繁上热搜的「肺炎支原体」，不仅感染数量明显增加，还出现了低龄化的特点，儿童成为中招大户。

齐碳科技发挥纳米孔测序的优势，提供更加准确、快捷、易用的一站式病原微生物检测分析平台。

什么是支原体感染？

肺炎支原体（MP）是非常常见的呼吸道病原体，既不属于细菌，也不属于病毒，属于非典型病原体，主要经飞沫传染，其感染一年四季均可发生，但多在秋冬时节。肺炎支原体感染时会导致患者的呼吸道受到不同程度的损伤，通常可引起上呼吸道感染（咽喉疼痛、咳嗽）、急性支气管炎、肺炎等。

据国家卫生健康委员会2023年2月发布的《儿童肺炎支原体肺炎诊疗指南（2023年版）》（后简称“指南”），肺炎支原体肺炎（MPP）多见于5岁及以上儿童，但5岁以下儿童也可发病，少数MPP可能发展为危重症。

来源：《儿童肺炎支原体肺炎诊疗指南（2023年版）》

如何进行肺炎支原体诊断？

肺炎支原体感染的临床表现与病毒感染、细菌感染所导致的临床表现相似，起病急、进展快、症状及体征不典型，仅凭症状可能无法准确判断是否为支原体肺炎。

肺炎支原体（MP）常见的实验室病原学诊断手段包括分离培养、核酸检测以及抗体检测等，不同方法学有不同优缺点。

检测方法：

肺炎支原体培养：是诊断MP感染的“金标准”，但由于MP培养需要特殊条件且生长缓慢，难用于临床诊断。
MP核酸检测：灵敏度和特异性高，适用于肺炎支原体肺炎（MPP）的早期诊断。
MP抗体测定：MP-IgM抗体一般在感染后4-5天出现，感染初期无法有效识别；免疫胶体金法可定性检测MP-IgM抗体，阳性提示MP感染，阴性则不能完全排除MP感染，可出现假阳性。

指南提示，MP培养是诊断MP感染的“金标准”，但由于MP培养需要特殊条件且生长缓慢，难以满足临床诊断应用需求。MP核酸检测包括MP-DNA或MP-RNA检测，灵敏度和特异性高，适用于MPP的早期诊断。

同时，指南也提出，肺炎支原体肺炎需要与常见病毒性肺炎，包括腺病毒肺炎、流感病毒肺炎、新型冠状病毒肺炎等，以及由肺炎链球菌和金黄色葡萄球菌等引起的细菌性肺炎进行鉴别和诊断。对于肺炎支原体感染的患者，尤其是中重症患者，除了常规的实验室检测外，如何快速高效判断混合感染、除外其他病原体感染并精准用药尤为重要。

不同于实验室研究，临床检测中更加要求敏感度高、结果准确，传统检验方式一旦面临复杂感染，可能暴露出繁琐，耗时，准确度有限等缺点，从而造成延迟诊断或漏诊。

因此，早发现、早诊断、早治疗成为感染性疾病防治与管理的关键举措，帮助临床对病原微生物进行有效的检测与溯源，从而为病原体定性定量、用药指导、免疫反应监测等提供可靠依据。

纳米孔测序助力快速检测

近年来，随着基因测序技术的快速发展为感染性疾病的快速诊断打开了一扇窗。

基于高通量测序技术快速发展的宏基因组测序（mNGS）成为检测复杂感染的有力工具。目前，病原微生物宏基因组测序已经在血流感染、神经系统感染、呼吸系统感染等多种类型的感染性疾病病原诊断中得到应用，并写入多项专家共识。

mNGS与传统检验方式对比

简而精的tNGS（targeted NGS）与mNGS广覆盖、无偏倚不同，tNGS所需数据量更小，检测速度更快，数据分析以及报告生成也更快。纳米孔靶向测序（Nanopore Targeted Sequencing， NTS）的出现，在纳米孔测序长读长、仪器小型便携等优势的加持下，可轻松跨越基因组中的SVs大片段，研究针对性强且所需数据量少，不仅能够有效鉴定结构变异，帮助获取更加完整的信息，提高病原体检测的效率和精度，还可以做到样本即来即测，无需凑样，大大缩短检测周期，无疑开拓了更广泛的应用空间。

一站式病原检测分析平台

为更好满足呼吸道相关疾病的精准诊断需求，齐碳科技基于自主研发的纳米孔基因测序仪开发了一站式病原检测分析平台，该平台整合了感染性样本的样本制备、文库构建、标准化纳米孔基因测序流程、多种类微生物基因组数据库和实时病原分析报告系统，操作更简单、检测更快捷、报告更直观，全面满足用户在不同场景下的病原快速检测需求。

通过齐碳自研的高效去宿主方案，仅需20分钟即可完成去宿主工作，一站式检测平台全流程6小时即可获得完整报告。

齐碳科技已陆续开展多场“纳米孔基因测序上门手把手培训"，齐碳可以为客户提供的培训包括：

猴痘/流感/诺如病毒等全基因组测序及生信分析；
未知病原宏基因组测序及生信分析；
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*齐碳科技纳米孔测序平台为科研级产品，仅供研究使用，不得用于诊断。如需获得治疗方案指导，请前往正规医院就诊。

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