欧洲顶级临床诊断实验室集团——斯耶莱柏集团(Synlab Group)在2009年12月5日表示,已开发出新的基于蛋白质组的微生物快速鉴定系统——MALDI Biotyper微生物鉴定系统——该系统将从2010年装备其旗下遍布欧洲的70余家诊断实验室。该鉴定系统由生命科学和分析仪器领域出色的领导者布鲁克•道尔顿公司开发。
研究员乌瑞科•科尼普(Dr. Ulrich Knipp)博士说:“该检测系统的原理是:每种微生物都有自身独特的蛋白质组成,因而拥有独特的蛋白质指纹图谱。MALDI Biotyper高通量微生物鉴定系统通过MALDI-TOF质谱仪测得待测微生物的蛋白质指纹谱图,通过Biotyper软件对这些指纹谱图进行处理并和数据库中各种已知微生物的标准指纹图谱进行比对,从而完成对微生物的鉴定。”
应用专家顾依杜•马克斯(Dr. Guido Mix)博士介绍了MALDI Biotyper微生物鉴定系统的优点:Biotyper数据库中已经含有三千多种微生物的特征指纹谱,其中包括我国二零零九年三月正式颁布实施的食品卫生微生物检验2009国家标准 (GB/T 4789) 中规定检验的细菌,如沙门氏菌、大肠埃希氏菌、单增细胞增生李斯特氏菌、双歧杆菌、小肠结肠炎耶尔森氏菌、粪大肠菌、金黄色葡萄球菌、空肠弯曲菌、乳酸菌以及来自海产品的副溶血性弧菌和婴幼儿配方食品、乳品和乳制品及其原料中必检的阪崎肠杆菌等。
有关布鲁克•道尔顿公司的MALDI Biotyper微生物鉴定系统:
MALDI Biotyper的工作原理:
MALDI Biotyper高通量微生物鉴定系统拥有如下的优点:
(1)操作简单、快速、通量高
单个微生物菌落或其它生物材料经简单的样品前处理(仅需几分钟)后,使用MALDI-TOF质谱仪进行测定。所获得的质谱图可直接送到Biotyper数据库进行检索。这个简单而独特的工作流程可以满足绝大多数微生物的鉴定,而且不需要进行革兰氏染色、氧化酶试验或选择PCR引物。一个样品从获得单克隆开始,到样品处理、谱图采集和获得鉴定结果可以在几分钟内完成,操作简单、快速,通量高。
(2)灵敏度高
使用经久耐用且性能可靠的布鲁克•道尔顿的MALDI-TOF系列仪器,可以实现高重复性的快速检测。由于仪器的高灵敏度,可以检测到低至100ng的细胞。如果采用已享盛名的布鲁克AnchorChip™技术,甚至25ng的样品就能满足需求。
(3)准确度好
MALDI-TOF获得的蛋白指纹图谱用作模式匹配,匹配分值用作鉴定结果的分级和归类。Biotyper软件对所得的图谱进行分析统一化,其复杂而精巧的校正和统计运算保证了鉴定的精确性。蛋白指纹主要集中在2-20kDa受到微生物生长环境和状态影响很小的持续高表达蛋白。强大的分析软件具有谱图校正功能。甚至偏离至5000ppm的质谱图都能够成功校正并鉴定。
MALDI Biotyper高通量微生物鉴定系统拥有如下的创新性:
(1) 优越、成熟的硬件技术。
MALDI Biotyper高通量微生物鉴定系统是建立在MALDI-TOF质谱仪上的。尽管多年来国际、国内的众多研究人员都在尝试建立基于MALDI-TOF技术的微生物鉴定技术,但大多受限于MALDI-TOF质谱技术的有效应用。布鲁克公司的FLEX系列MALDI-TOF质谱仪历经十多年的开发已经非常的成熟,采用了很多专利技术,各项性能指标均很优越,公司并针对微生物检测和鉴定专门开发了专属的样品制备和测定系统,并做了大量认真、细致的研究工作,形成了目前这套准确度高,灵敏度高而且重复性非常好的微生物检测、鉴定系统。
(2) 设计新颖的Biotyper软件。
BioTyper软件是MALDI Biotyper高通量微生物鉴定系统的一个重要组成部分。这一软件与布鲁克的MALDI-TOF质谱仪的仪器控制和数据采集软件配套并且有机地结合在一起,使用了数据库服务器和客户端分离的模式,采用先进的算法,可以自动化地快速处理大量的数据,以达到高通量准确鉴定的目的。此外,软件的用户界面友好,使用方便。
(3) 开放式的Biotyper微生物蛋白特征指纹图谱数据库系统。
MALDI Biotyper高通量微生物鉴定系统的另一个重要组成部分是Biotyper微生
物蛋白特征指纹图谱数据库系统。这一数据库系统采用开放式的设计,使用简单,占用资源少,使用服务器和客户端架构,既可使用专用的电脑服务器,也可以单机使用,方便、快捷地大批量地处理数据,无需专人维护。目前数据库中已经含有常见的近3290种微生物的特征指纹图谱,而且还在不断增加中。此外,用户可以根据自己的需要,轻松地添加所获得的新的微生物特征指纹图谱,并用于日常检测、鉴定工作中。
(4) 大量实际应用经验积累
MALDI Biotyper高通量微生物鉴定系统的开发过程中得到了诸如德国微生物和细胞培养收集中心、美国农业部农业研究服务中心食品微生物学部及其他众多欧美政府部门和大学、医院、研究所等科研单位的支持,在多方合作的努力下,积累了大量实际应用经验,并且这一系统已经在这些地方得到了充分地应用。专家们一致认为MALDI Biotyper具有快速简便的工作流程和强大可靠的数据处理能力,是微生物鉴别与分类中的最新技术。
(5)在我国食品安全等领域中的应用
近几年相继发生的几起食品安全事件,引起人们对食品安全问题的广泛关注。我国监管部门也越发加强了对食品安全问题的重视。如2008年12月29日发布、2009年4月1日开始实施的新国标GB/T 8538-2008《饮用天然矿泉水检验方法》,就提高了对饮用水的检测要求,要求对饮用天然矿泉水及其灌装水进行粪链球菌、铜绿假单胞菌和产气荚膜梭菌等3项微生物指标的检验。而Biotyper数据库中已经有这些菌的标准图谱,可以很方便地进行这些菌的检测,可以用于自来水和其它饮用水中的微生物鉴定。
来源于:美国布鲁克·道尔顿公司北京代表处
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