赛默飞世尔科技于国际蛋白质组学大会(HUPO)上发布一个包括五个软件解决方案的新系列,可提高定性和定量蛋白质组学工作流程
澳大利亚悉尼(2010年9月20日) - 全球科学服务领域的领导者赛默飞世尔科技公司,于2010年国际蛋白质组学大会(HUPO)上宣布发布一个包括五个互补性软件解决方案的系列,致力于在定性和定量蛋白质组学应用中取得突破性进展。该软件解决方案结合现代最新技术的Thermo Scientific质谱仪,可为研究者提供快速简便而强大的工作流程,帮助他们应对蛋白质组学研究中不断涌现的挑战。这些解决方案将帮助关键工业创新项目取得进步,如2010年国际蛋白质组学大会(HUPO)的人类蛋白质组计划。
“HUPO上发布的软件创新方案加强了我们在定性和定量蛋白质组学领域中业界领先的工作流程,”赛默飞世尔科技生命科学质谱部门的蛋白质组学市场总监Andreas Huhmer说到,“这个独特的软件系列补充了Thermo Scientific质谱仪的功能,样品制备和色谱技术,有助于研究者在蛋白质组学领域中获得成功。该系列涵盖范围从复杂的蛋白质识别,磷蛋白质表征,蛋白质相对定量到潜在生物标志物的确认。”
ProteinCenter软件将质谱数据转换为有用的生物信息
全新Thermo Scientific ProteinCenter软件是一个基于网络的工具,可对蛋白质组学数据执行更快更好的积分,解析和共享。它连接着来自Thermo Scientific Proteome Discoverer软件的以多肽为中心的信息,该软件还具有以蛋白质为中心内容的常用生物数据库,如UniProt和NCBI数据库。用户可利用这些数据库在数分钟内完成数据的比较和解析。 ProteinCenterTM 软件现在包括超过1300万个独特的蛋白质序列,并隔周访问,更新和整合面向公众的蛋白质信息。
Proteome Discoverer软件提高生产率和定量结果准确性
Thermo Scientific Proteome Discoverer软件是一个用于蛋白质组学数据的定量和定性分析的综合平台。该软件在基于工作流程的图形用户界面上,为大量的蛋白质组学实验提供了一系列生物软件工具和自定义工作流程,满足用户对灵活性的需求。该软件经过优化后可以充分利用Thermo Scientific质谱仪提供的高分辨率数据和多种互补性的碎裂方法。
Proteome DiscovererTM 软件具有提高生产率和定量结果准确性的新功能。它还支持细胞培养氨基酸稳定同位素标记技术(SILAC),以加速不同处理细胞群体的蛋白质表达水平的定量分析过程。这简化了复杂的SILAC实验数据的分析过程。该软件还可利用同量异序化学标签(如Thermo Scientific串联分子量标签,TMT)以及结果的统计分析,增强了相对定量能力。多肽识别的灵活处理提高了蛋白覆盖率,而且现在可以自动进行相对定量,数据采集以及处理。
SIEVE软件自动对无标记数据进行差异分析
Thermo Scientific SIEVE 软件是对无标记的蛋白质,多肽和代谢物进行半定量差异表达分析的一种自动化解决方案。使用 SIEVETM 软件预过滤数据可显著减少待识别组分的数量,由此显著增加了复杂生物标志物发现实验的通量。
SIEVE软件帮助可靠识别蛋白质,还可利用机器学习算法计算假阳性率。该软件还包括一种新的统计分析能力(受试者工作特征,ROC),可识别疾病和正常蛋白之间的差异,有利于分析一个和多个潜在生物标志物的相关性。SIEVE软件现在提供样品浓度的归一化处理,以自动调整差异分析结果的表达率。与Proteome Discover软件的全面整合,使得用户可以将强大的蛋白质检索识别能力应用到蛋白质差异分析结果中。
Pinpoint软件提高生产率和结果准确性
Thermo Scientific Pinpoint 软件简化了从早期生物标志物发现到潜在生物标志物的大规模定量验证的转变过程。它帮助研究者分析采集到的研发数据,利用智能SRM(iSRM)加速和简化了所有实验方法的定量分析过程。Thermo Scientific TSQ 三重四极杆质谱仪具有iSRM功能。该功能设计用于提高目标物定量分析的灵敏度,选择性和通量,可在一次运行中同时确认和定量数千种目标多肽。
PinpointTM 软件利用保留时间模型简化重复性实验,最小化不同运行之间的变化,并提高结果可靠性。全新多肽筛选算法提高了多肽识别能力。
ProSightPC软件可靠识别和表征完整蛋白质
Thermo Scientific ProSightPC 软件利用Thermo Scientific质谱仪提供的离子对质量的高度准确性,可靠地识别和表征多肽和完整蛋白质。ProSightPC 软件与Proteome Discover 软件互为补充,并处理来自自上而下(top-down)或者自下而上(bottom-up)实验的准确的MS/MS数据,包括带有序列变异体和翻译后修饰(PTMs)的蛋白质。重要的是,它在数据库检索中优先考虑生物学知识。该软件还提供一种灵活的检索模式,用于识别未知或未预期的修饰。ProSightPC 软件利用高质量准确性减少了多次碎裂的复杂性,可识别一个MS/MS实验中的多个碎片离子。
关于赛默飞世尔科技
赛默飞世尔科技(纽约证交所代码:TMO)是全球科学服务领域的领导者,致力于帮助客户使世界更健康、更清洁、更安全。公司年度营收达到100多亿美元,拥有员工35,000多人服务客户。这些客户包括:医药和生物技术公司、医院和临床诊断实验室、大学、科研院所和政府机构以及环境与工业过程控制装备制造商等。公司借助 Thermo Scientific 和 Fisher Scientific 这两大品牌,帮助客户解决从常规测试到复杂的研发项目中所面临的各种分析方面的挑战。Thermo Scientific向客户提供了一整套完整的高端分析仪器、实验室设备、软件、服务、耗材和试剂,以实现实验室工作流程综合解决方案。Fisher Scientific 为卫生保健、科学研究,安全和教育领域的客户提供完整的实验室装备、化学药品、供应品和服务的组合。赛默飞世尔科技将努力为客户提供最为便捷的采购方案,为科研的飞速发展不断地改进工艺技术,并提升客户价值,帮助股东提高收益,还为员工创造良好的发展空间。欲了解更多信息,请浏览公司网站:
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