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复旦王永明团队开发出高精准CRISPR基因编辑工具酶 多场景可取代SpCas9

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导读:王永明研究团队经过鉴定和改造,开发出了SlugCas9-HF工具酶,性能突出,它识别简单的NNGG PAM,具备活性高、精准性高、编辑范围广、基因小等优点。

CRISPR/Cas9被誉为“基因魔剪”,是基因编辑的利器,在基础研究、农业育种和基因治疗等领域得到了广泛应用。但是CRISPR/Cas9工具还存在很多局限,常用的SpCas9编辑范围广,活性高,但是其基因较大,给病毒载体递送带来困难。常用的SaCas9基因小,但是编辑范围小。其他Cas9活性低,应用较少。

为了找到理想的Cas9工具酶,复旦大学王永明课题组建立了大规模筛选Cas9的平台,对自然界中数百种Cas9进行系统性筛查。2020年该课题组筛选到了SauriCas9,具备活性高、编辑范围广、基因小等优点,但是精准性不理想,介于SpCas9和SaCas9之间。

2021年3月15号,王永明课题组联合王红艳和李继喜课题组,在 Nucleic Acids Research 杂志发表了题为:Discovery and engineering of small SlugCas9 with broad targeting range and high specificity and activity的研究论文。

研究团队经过鉴定和改造,开发出了SlugCas9-HF工具酶,性能突出,它识别简单的NNGG PAM,具备活性高、精准性高、编辑范围广、基因小等优点

复旦王永明团队开发出高精准CRISPR基因编辑工具酶  多场景可取代SpCas9

研究团队同时还开发出ShaCas9、SlutrCas9、Sa-SlugCas9等工具。为了方便研究人员选择合适的工具酶使用,作者对本团队开发的7种工具酶和SaCas9的活性和精准性进行了比较。综合看,SlugCas9-HF在编辑活性、精准性和编辑范围都具有优势

复旦王永明团队开发出高精准CRISPR基因编辑工具酶  多场景可取代SpCas9

在12个内源位点对8个工具酶活性进行比较

该研究的第一作者胡子英博士兴奋地说:“我们后继工作对SlugCas9-HF和SpCas9的活性进行了比较,它们活性没有差异。也就是说SlugCas9-HF兼具了SpCas9和SaCas9的优点。这是我们一直寻找的理想工具酶,它在很多场景都可以取代SpCas9和SaCas9。我们还找到很多有优点的工具酶,将陆续与同行分享。”

复旦王永明团队开发出高精准CRISPR基因编辑工具酶  多场景可取代SpCas9

利用GFP报告基因对8个工具酶在脱靶位点的编辑效率进行比较。在脱靶位点编辑效率越低精准性越高。

胡子英博士和张成东博士是论文的共同第一作者,王永明教授、王红艳教授和李继喜教授是论文的共同通讯作者。


跟着我们涨知识!由仪器信息网举办的第五届PCR技术网络会议将于4.14日-4.16日举行,我们特别邀请到王永明老师给我们讲诉这把神奇的基因魔剪,大家千万不要错过噢~点击此处即可报名听会!

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来源于:E药世界

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CRISPR/Cas9被誉为“基因魔剪”,是基因编辑的利器,在基础研究、农业育种和基因治疗等领域得到了广泛应用。但是CRISPR/Cas9工具还存在很多局限,常用的SpCas9编辑范围广,活性高,但是其基因较大,给病毒载体递送带来困难。常用的SaCas9基因小,但是编辑范围小。其他Cas9活性低,应用较少。

为了找到理想的Cas9工具酶,复旦大学王永明课题组建立了大规模筛选Cas9的平台,对自然界中数百种Cas9进行系统性筛查。2020年该课题组筛选到了SauriCas9,具备活性高、编辑范围广、基因小等优点,但是精准性不理想,介于SpCas9和SaCas9之间。

2021年3月15号,王永明课题组联合王红艳和李继喜课题组,在 Nucleic Acids Research 杂志发表了题为:Discovery and engineering of small SlugCas9 with broad targeting range and high specificity and activity的研究论文。

研究团队经过鉴定和改造,开发出了SlugCas9-HF工具酶,性能突出,它识别简单的NNGG PAM,具备活性高、精准性高、编辑范围广、基因小等优点

复旦王永明团队开发出高精准CRISPR基因编辑工具酶  多场景可取代SpCas9

研究团队同时还开发出ShaCas9、SlutrCas9、Sa-SlugCas9等工具。为了方便研究人员选择合适的工具酶使用,作者对本团队开发的7种工具酶和SaCas9的活性和精准性进行了比较。综合看,SlugCas9-HF在编辑活性、精准性和编辑范围都具有优势

复旦王永明团队开发出高精准CRISPR基因编辑工具酶  多场景可取代SpCas9

在12个内源位点对8个工具酶活性进行比较

该研究的第一作者胡子英博士兴奋地说:“我们后继工作对SlugCas9-HF和SpCas9的活性进行了比较,它们活性没有差异。也就是说SlugCas9-HF兼具了SpCas9和SaCas9的优点。这是我们一直寻找的理想工具酶,它在很多场景都可以取代SpCas9和SaCas9。我们还找到很多有优点的工具酶,将陆续与同行分享。”

复旦王永明团队开发出高精准CRISPR基因编辑工具酶  多场景可取代SpCas9

利用GFP报告基因对8个工具酶在脱靶位点的编辑效率进行比较。在脱靶位点编辑效率越低精准性越高。

胡子英博士和张成东博士是论文的共同第一作者,王永明教授、王红艳教授和李继喜教授是论文的共同通讯作者。


跟着我们涨知识!由仪器信息网举办的第五届PCR技术网络会议将于4.14日-4.16日举行,我们特别邀请到王永明老师给我们讲诉这把神奇的基因魔剪,大家千万不要错过噢~点击此处即可报名听会!

复旦王永明团队开发出高精准CRISPR基因编辑工具酶  多场景可取代SpCas9